当在执行过程中发现公司已经被注销，这确实是一个需要细致处理的问题。以下是我为您提供的详细解答，希望能帮助您理清思路，采取正确的应对措施。
一、核实注销情况与合法性审查
查询注销信息：
- 您首先需要通过工商登记信息、税务登记信息或相关公告等渠道，核实公司的注销情况是否真实存在，以及注销的具体时间和原因。这是后续所有行动的基础。
审查注销程序：
- 根据《公司法》的相关规定，公司注销前必须依法进行清算，包括通知已知债权人，并在报纸上进行公告。您需要检查这些程序是否都已合规完成。如果注销程序存在瑕疵，如未按规定通知债权人或清算过程中存在违法违规行为，那么该注销行为可能无效或可撤销。
调查股东及清算组责任：
- 如果公司注销存在违法情形，股东可能需要承担连带责任。特别是当股东在公司清算时未履行清算义务，导致公司财产流失无法清偿债务时，他们的责任更为重大。同时，清算组成员在清算过程中如果存在故意或者重大过失，给债权人造成损失的，也应当承担赔偿责任。
二、评估法律影响与处理措施
债务处理：
- 如果公司在注销前存在未清偿的债务，您作为债权人，可以主张原股东在出资范围内承担清偿责任，或者依据股东在注销时的承诺要求其承担责任。
合同履行与违约责任：
- 对于公司注销前未履行完毕的合同，您作为合同相对方，有权要求原股东承担相应的合同违约责任，包括继续履行合同或赔偿损失。
侵权责任与行政责任：
- 如果公司在运营过程中存在侵权行为或违反行政法规的行为，即使公司已经注销，相关权利人或行政机关仍可能追究原股东的侵权责任或进行行政处罚。
三、法律救济途径
申请追加被执行人：
- 在执行阶段，如果您发现股东或其他相关责任人存在应当承担责任的情形，可以向执行法院申请追加他们为被执行人，并要求其承担清偿责任。
提起诉讼：
- 如果无法通过追加被执行人的方式解决问题，或者存在其他复杂的法律纠纷，您可以另行提起诉讼，要求相关责任人承担责任。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明自己的主张。
四、关注后续事宜与风险防范
税务处理与印章销毁：
- 即使公司已经注销，您仍需关注其税务处理情况，确保所有税款已结清。同时，应妥善销毁公司印章，以避免被他人滥用。
档案保存与法律风险防范：
- 保存好与公司相关的所有档案资料，以备不时之需。同时，应密切关注可能的法律风险，并采取必要的防范措施来保护自己的合法权益。
综上所述，当发现执行对象公司已被注销时，您应全面核实注销情况与合法性，评估法律影响，并采取相应措施追究相关责任人的责任或通过法律途径寻求救济。同时，还应关注后续事宜与风险防范工作，以确保自身权益得到最大程度的保障。希望这些建议能对您有所帮助。