针对您提出的“项目所在地和公司所在地不一样，如何起诉”的问题，这确实是一个涉及诉讼管辖权的常见问题。下面我将结合相关法律规定和实际案例，为您详细解答。

一、诉讼管辖权的基本原则

在民事诉讼中，管辖权是确定哪个法院有权审理案件的基础。一般来说，管辖权主要依据被告住所地、合同履行地、侵权行为地等因素来确定。当项目所在地与公司所在地不一致时，我们需要根据具体情况来判断哪个法院具有管辖权。

二、项目所在地与公司所在地不一致时的管辖权确定

1. 合同纠纷：

   • 如果纠纷涉及合同，且合同中有明确的管辖协议，那么应按照协议来确定管辖法院。
   • 如果合同中没有管辖协议，或者协议无效，那么可以根据合同履行地来确定管辖法院。合同履行地通常是指合同中约定的履行义务的地点，如果合同没有约定或者约定不明确，可以根据实际履行情况来确定。在项目类合同中，项目所在地往往被视为合同履行地之一。

2. 侵权纠纷：

   • 如果纠纷涉及侵权行为，那么侵权行为地法院通常具有管辖权。侵权行为地包括侵权行为实施地和侵权结果发生地。在项目类纠纷中，如果侵权行为发生在项目所在地，那么项目所在地法院可能具有管辖权。

3. 公司诉讼的特殊情况：

   • 如果纠纷涉及公司内部事务，如股东权益纠纷、公司解散纠纷等，那么通常由被告住所地或者公司住所地法院管辖。但需要注意的是，如果公司的主要办事机构所在地与注册地不一致，应以主要办事机构所在地为住所地来确定管辖法院。

三、实际案例与操作建议

以您提供的参考信息中的案例为例，在“马来西亚和某公司诉香港利某贸易公司等买卖合同纠纷案”中，尽管原被告均非中国内地主体，且没有明确的管辖协议，但上海国际商事法庭最终确认了管辖权。这是因为案涉货物仓储地、实际收货人住所地、交易相关单证收件地等均与上海存在联系，且由上海法院审理更有利于查明案件事实。

操作建议：

1. 收集证据：在起诉前，您需要收集与纠纷相关的证据材料，包括合同、交易记录、沟通记录等，以证明项目所在地与纠纷之间的关联性。

2. 确定管辖法院：根据纠纷类型和证据材料，确定具有管辖权的法院。如果项目所在地与纠纷有密切联系，且符合相关法律规定，那么项目所在地法院可能具有管辖权。

3. 提交起诉材料：向选定的法院提交起诉材料，包括起诉状、证据材料等，并按照法院的要求缴纳诉讼费用。

4. 参与诉讼过程：在诉讼过程中，积极配合法院的工作，参与庭审、调解等环节，以维护自己的合法权益。

四、注意事项

• 在起诉前，务必仔细研究相关法律规定和案例，确保自己的起诉符合法律要求。
• 如果对管辖权有疑问，可以咨询专业律师或法律机构，以获取更准确的法律意见。
• 在诉讼过程中，保持与法院的沟通联系，及时了解案件进展情况，并根据需要调整诉讼策略。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。