结论前置：机动车与无牌摩托车发生事故后，交警扣押机动车在符合法定条件和程序的情况下是合法的。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，公安机关交通管理部门在处理交通事故时，有权根据事故现场勘验、检查、调查情况和有关的检验、鉴定结论，及时制作交通事故认定书，作为处理交通事故的证据。同时，为了收集证据、查明事实，公安机关交通管理部门有权扣留事故车辆。

2. 扣押条件：

   • 交警扣押机动车并非随意行为，而是需要满足一定的条件。通常，这些条件包括：事故现场需要进一步勘验、检查以收集证据；事故车辆可能涉及违法或犯罪行为；需要检验、鉴定事故车辆以确定事故责任等。在机动车与无牌摩托车发生事故的情况下，由于无牌摩托车本身可能存在违法上路的情况，交警为了全面调查事故原因和责任，扣押机动车以进行进一步的勘验、检查或鉴定是合理的。

3. 扣押程序：

   • 交警在扣押机动车时，应当遵循法定的程序。这包括出具扣押决定书、告知当事人扣押的理由和依据、以及告知当事人享有的权利等。同时，交警还应当在扣押后及时进行勘验、检查或鉴定，并在规定的时间内作出处理决定。如果交警在扣押过程中违反了法定程序，那么扣押行为可能被视为违法。

4. 特殊情况考虑：

   • 需要注意的是，虽然交警在符合法定条件和程序的情况下有权扣押机动车，但并非所有情况下都必须扣押。例如，如果事故现场已经勘验完毕，且事故责任已经明确，那么交警可能无需再扣押机动车。此外，如果机动车驾驶人能够提供足够的证据证明其无过错或过错较小，且事故车辆并非必须扣押以进行进一步勘验、检查或鉴定，那么交警也可能考虑不扣押机动车。

法律建议：

• 如果您的机动车因与无牌摩托车发生事故而被交警扣押，您首先应当了解扣押的理由和依据，并确认交警是否遵循了法定的程序。
• 如果您认为交警的扣押行为违法或不当，您可以向交警部门提出异议或申请行政复议。
• 在处理此类事故时，建议您积极配合交警的调查工作，并提供必要的证据和资料以协助查明事故原因和责任。

后续行动：

• 如果您对交警的扣押决定有异议或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。