结论：民营医院在使用的大楼，若产权属于股东，该股东在符合一定条件下是可以将其抵押的。但具体能否抵押以及抵押的效力，还需根据大楼的实际使用情况、抵押合同的具体内容以及相关法律法规的规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、产权归属与抵押权设立的基础
产权归属：根据物权法原理，产权归属是设立抵押权的基础。若大楼的产权确实属于股东个人所有，而非医院所有，那么股东作为产权人，有权对其财产进行处分，包括设立抵押权。
抵押权设立：抵押权的设立需要满足一定的法律形式要件，如签订书面抵押合同、办理抵押登记等。若股东与抵押权人签订了有效的抵押合同，并依法办理了抵押登记，那么抵押权即设立成功。
二、大楼使用情况对抵押的影响
医院使用不影响产权：民营医院在使用大楼，但这并不改变大楼的产权归属。医院的使用行为是基于与股东之间的租赁、借用或其他法律关系，这些关系并不影响股东作为产权人对大楼的处分权。
抵押可能影响医院使用：然而，若股东将大楼抵押后，抵押权人实现抵押权时，可能会涉及到大楼的处置问题，如拍卖、变卖等。这可能会对民营医院的使用造成影响，甚至导致医院无法继续使用该大楼。
三、相关法律法规的考量
《民法典》关于抵押的规定：根据《民法典》的相关规定，债务人或者第三人有权处分的下列财产可以抵押：（一）建筑物和其他土地附着物；（二）建设用地使用权；…等。因此，若大楼属于股东有权处分的财产，且符合其他抵押条件，是可以设立抵押权的。
医院特殊性质的考量：虽然民营医院在性质上属于营利性法人，但其作为提供医疗服务的机构，具有一定的社会公益性。在设立抵押时，应充分考虑这一因素，避免因抵押权的实现而对医院的正常运营造成过大影响。
四、实际操作中的建议
明确产权归属：在设立抵押前，应明确大楼的产权归属，确保股东有权处分该财产。
签订详细抵押合同：抵押合同应详细约定抵押物的范围、抵押期限、抵押权实现的条件等条款，以避免未来可能出现的纠纷。
办理抵押登记：依法办理抵押登记是设立抵押权的必要步骤，也是保障抵押权人权益的重要手段。
考虑医院运营影响：在设立抵押时，应充分考虑抵押权的实现可能对医院运营造成的影响，并采取相应的风险防范措施。
进一步思考：若民营医院与股东之间存在关于大楼使用的特殊约定，如长期租赁合同等，这些约定可能会对抵押权的设立和实现产生影响。因此，在设立抵押前，应仔细审查相关合同和协议，确保抵押权的设立不会违反这些约定。
最后，若您在债务债权（抵押担保）或公司法务领域有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。