公司制定的霸王条款制度是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律定义与性质

霸王条款，通常指的是一些经营者单方面制定的逃避法定义务、减免自身责任的不平等的格式合同、通知、声明和店堂告示或者行业惯例等。这些条款往往违反了公平、等价有偿、诚实信用等基本原则，侵害了消费者的合法权益。在劳动法律关系中，如果公司制定的制度包含类似霸王条款的内容，同样是不合法的，因为它违反了劳动法律法规中关于保护劳动者权益的基本原则。

法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》：该法明确规定了劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止等各个环节，强调了劳动合同的平等性和自愿性。如果公司制定的制度违反了这些原则，比如强制要求劳动者承担不合理的责任、剥夺劳动者的合法权益等，那么这些制度就是无效的。

2. 《中华人民共和国消费者权益保护法》（虽主要针对消费者，但原理相似）：该法也强调了经营者在提供商品或服务时应当遵循公平、诚实信用的原则，不得设定不公平、不合理的交易条件。这一原则同样适用于劳动法律关系中，公司不得制定霸王条款来侵害劳动者的权益。

实际后果与风险

1. 法律后果：如果公司制定的霸王条款制度被认定为无效，那么这些条款将不会对劳动者产生约束力。公司可能因此面临劳动争议、行政处罚等法律风险。

2. 声誉风险：霸王条款制度往往会引起劳动者的不满和抵制，进而影响公司的声誉和形象。在竞争激烈的市场环境中，良好的声誉是企业宝贵的无形资产，一旦受损，将难以修复。

应对建议

1. 审查制度：公司应当定期审查其制定的各项制度，确保它们符合法律法规的要求，不包含霸王条款的内容。

2. 协商修改：如果发现制度中存在不合理或不合法的条款，公司应当及时与劳动者或工会进行协商，对条款进行修改或废除。

3. 寻求法律帮助：如果公司在制定或修改制度时遇到法律难题，可以寻求专业律师的帮助，以确保制度的合法性和有效性。

作为劳动者，如果你发现公司制定的制度中包含霸王条款的内容，你有权向公司提出异议，并要求公司进行修改。如果公司拒绝修改或你因此遭受了损失，你可以向劳动监察部门投诉或寻求法律途径来维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。