针对您提出的“公司有员工起诉时是否可以变更股份”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我为您提供的详细解答：

一、起诉与股权变更的基本关系

起诉本身并不直接导致股权的变更。股权的变更通常需要通过股权转让、增资扩股、减资退股等法定方式来实现，并需遵循公司法、公司章程以及相关的工商登记程序。然而，在某些特定情况下，起诉可以作为推动股权变更的一种法律手段。例如，当员工（作为股东）与公司或其他股东之间因股权转让、股东资格确认、股东权益侵害等产生纠纷时，员工可以通过诉讼来寻求法律救济，进而可能推动股权的变更。

二、公司被起诉期间股权变更的可行性

1. 法律框架：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的股东及其出资比例是可以通过股权转让等方式进行变更的。这一权利并未因公司被起诉而受到直接限制。因此，从法律层面讲，公司被起诉期间是可以进行股权变更的。

2. 可能的影响：

   • 诉讼案件性质：如果诉讼案件涉及公司股权结构或股东权益的重大争议，如股权确认之诉、股东之间的纠纷等，那么在公司解决这些争议之前，进行股权变更可能会受到一定的限制或影响。因为股权变更可能改变诉讼的标的或影响诉讼的结果。
   • 公司章程规定：公司章程可能对股东变更有特殊规定，如需要特定条件或程序才能变更股东。在这种情况下，即使公司被起诉，也需要遵守公司章程的规定来进行股权变更。
   • 债权人利益保护：如果公司被起诉是因为拖欠债务等原因，债权人可能会关注公司的股权变动情况，以确保其债权的实现不受影响。如果股权变更可能导致公司资产减少或偿债能力下降，债权人可能会提出异议或采取其他措施来保护自己的利益。

3. 实际操作建议：

   • 咨询专业律师：由于每个具体案件的情况都有所不同，且涉及复杂的法律关系和程序要求，因此在决定进行股权变更前，建议咨询专业律师以获取针对性的法律意见。
   • 履行法定程序：无论公司是否被起诉，股权变更都需要遵循一定的法定程序，如签订股权转让协议、办理工商变更登记等。在操作过程中，应确保所有手续都合法合规，以避免可能的法律风险。
   • 通知相关方：股权变更后，应及时通知公司的债权人、债务人等相关方，以确保他们了解公司的最新情况并采取相应的措施。

三、总结与建议

公司有员工起诉时是否可以变更股份，取决于诉讼案件的性质、公司章程的规定以及法律法规的要求。如果诉讼案件不涉及股权结构或股东权益的重大争议，且股权变更行为合法合规，不影响诉讼的正常进行，那么原则上是可以进行的。然而，为了确保股权变更的合法性和有效性，并避免可能的法律风险，建议在决定进行股权变更前咨询专业律师，并严格遵循法定程序和要求进行操作。