购房合同未约定份额的情况下，办理房产证时仍可进行产权份额登记，但需根据实际情况选择处理方式。具体分析如下：

1. 未约定份额的法律后果
   根据《民法典》第297条，不动产可由两个以上组织或个人共有，共有包括按份共有和共同共有。若购房合同未明确约定份额，则默认按共同共有处理（如夫妻共同购房），或需通过补充协议、实际出资比例等证据推定份额。

2. 办理房产证时的操作方式

   • 若需明确份额：需在办理房产证前，通过书面协议（如补充合同、共有协议）约定各共有人份额，并提交至不动产登记中心。例如，双方可协商按出资比例登记份额（如甲方70%、乙方30%）。
     
   • 若未约定份额：不动产登记中心可能按“共同共有”登记，即不划分具体比例，所有共有人对房产享有平等权利。但需注意，共同共有在处分房产时需全体共有人同意，可能影响后续交易或抵押。

3. 风险提示与建议

   • 风险：未约定份额可能导致共有人之间权责不清，引发纠纷（如一方擅自处分房产、收益分配争议等）。
     
   • 建议：
     
     • 优先通过补充协议明确份额，避免后续争议；
       
     • 若无法协商一致，可依据《民法典》第309条，按“等分原则”处理（即均分），但需提供出资证明等证据支持；
       
     • 办理房产证时，务必核对登记内容是否与约定一致，确保权益。

总结：购房合同未约定份额不影响房产证办理，但建议提前明确份额并登记，以保障权益。如有具体案例或细节需进一步分析，可直接向我咨询。