结论：排除妨碍行为人已经完工投入使用，并不直接决定物权能否确权发证。物权的确权发证主要取决于是否满足物权设立、变更、转让和消灭的相关法律规定，以及是否完成了相应的登记手续。

分析说明：

1. 物权确权发证的基本条件：

   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于物权的相关规定，物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
   • 因此，物权的确权发证，关键在于是否完成了法定的登记手续，以及是否符合物权设立、变更、转让和消灭的法律规定。

2. 排除妨碍行为与物权确权发证的关系：

   • 排除妨碍是指当物权的行使受到他人的不法阻碍时，物权人有权请求排除该阻碍，以恢复物权的圆满状态。这是一种物权保护方式，旨在保障物权人的合法权益不受侵害。
   • 排除妨碍行为的完成，并不意味着物权已经设立或变更，也不直接决定物权能否确权发证。它只是恢复了物权人原本应有的物权行使状态。

3. 物权确权发证的具体流程：

   • 通常，物权的确权发证需要经过申请、审核、登记、发证等步骤。申请人需要提交相关证明材料，如购房合同、身份证明等，以证明其物权归属。
   • 登记机构会对申请材料进行审核，确认无误后，会进行登记并颁发相应的物权证书。

4. 特殊情况下的物权确权发证：

   • 在某些特殊情况下，如历史遗留问题、政策性住房等，物权的确权发证可能受到特定政策或法规的调整。此时，需要依据相关政策或法规进行办理。
   • 另外，如果排除妨碍行为涉及的是违法建筑或未经批准的建筑，那么即使行为已经完工投入使用，也可能无法获得物权确权发证。

行动建议：

• 如果您是物权人，且希望获得物权确权发证，建议您首先确认自己的物权是否已经依法设立或变更，并完成了相应的登记手续。
• 如果您的物权行使受到他人的不法阻碍，您可以依法请求排除妨碍，以恢复物权的圆满状态。但请注意，排除妨碍行为的完成并不直接决定物权能否确权发证。
• 如果您在物权确权发证过程中遇到任何问题或困难，建议您及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。

法律后果：

• 如果物权人未依法进行物权登记，其物权可能无法得到法律的有效保护，也可能无法获得物权确权发证。
• 如果排除妨碍行为涉及违法建筑或未经批准的建筑，物权人可能面临行政处罚或法律责任，同时也可能无法获得物权确权发证。