针对药品仓库内发现过期药品的问题，这确实是一个严重的违法行为，需要依据相关法律法规进行严肃处理。以下是对此问题的详细解答：
一、主要法律法规依据
《中华人民共和国药品管理法》：该法明确规定，禁止生产、销售劣药，而过期药品属于劣药的范畴。因此，药品仓库内存放过期药品，若未及时清理并可能流入市场，即构成违法行为。
《中华人民共和国刑法》：若销售过期药品的行为情节严重，如造成人员伤害或社会影响恶劣，可能触犯刑法中的相关罪名，如生产、销售伪劣产品罪等。
二、处罚措施
行政处罚：
- 没收违法所得和药品：执法部门将没收因过期药品可能产生的违法收入，并收缴仓库内所有过期药品。
- 罚款：根据《药品管理法》，罚款金额将根据违法药品的货值金额来计算。若货值金额不足一万元，罚款基数将按一万元计算，并处以二万元以上五万元以下的罚款；若货值金额一万元以上，则处以货值金额十倍以上二十倍以下的罚款。对于批发环节涉及的过期药品，若货值金额不足十万元，罚款基数将按十万元计算。
- 停产停业整顿或吊销许可证：若情节严重，相关部门可以责令药品仓库或关联药店停产停业进行整顿。若情况特别恶劣，将吊销药品批准证明文件、药品经营许可证等，意味着相关企业将无法继续合法经营药品业务。
- 责令改正：要求立即停止与过期药品相关的所有活动，并采取措施消除可能产生的危害后果。
刑事责任：
- 如果过期药品的销售行为造成了人员伤害后果或其他严重社会影响，可能涉及更严重的法律责任，包括民事赔偿责任。
- 若行为触犯《中华人民共和国刑法》的相关规定，如构成生产、销售劣药罪或其他相关罪名，将依法定罪处罚，可能面临有期徒刑、拘役和罚金等刑事处罚。
三、建议与总结
- 严格遵守药品管理法规：药品仓库应定期检查并清理过期药品，确保药品的质量和安全。同时，应建立完善的药品管理制度，防止过期药品流入市场。
- 加强员工培训：提高员工对药品管理法规的认识和遵守意识，确保他们了解过期药品的危害性和处理流程。
- 及时举报违法行为：如果发现药品仓库或药店存在销售过期药品的行为，应及时向相关部门举报，共同维护药品市场的秩序和消费者的合法权益。
综上所述，药品仓库内发现过期药品将面临严厉的法律处罚，包括行政处罚和可能的刑事责任。因此，相关企业必须严格遵守药品管理法规，确保药品的质量和安全。