在行政案件中，行政机关一般不可以直接开具检查证进行搜查，但特定情况下，如涉及危害国家安全等紧急情形，可能有例外规定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 一般原则：

   • 在行政案件中，行政机关的执法活动通常受到法律的严格限制。搜查作为一项较为严厉的执法手段，一般不适用于普通的行政案件。行政机关在执法过程中，应当遵循合法、合理、必要等原则，确保执法活动的合法性和正当性。
   • 检查证通常是用于特定行政检查活动的凭证，但它并不等同于搜查证。搜查证通常是由司法机关（如法院、检察院）在刑事诉讼中签发的，用于对犯罪嫌疑人或相关场所进行搜查的法律文书。

2. 特定情形下的例外：

   • 虽然一般情况下行政机关不能开具搜查证进行搜查，但在某些特定情形下，如涉及危害国家安全、社会公共安全等紧急情况，法律可能赋予行政机关一定的搜查权力。然而，这种权力通常受到严格的法律限制和程序要求，以确保不会滥用。
   • 例如，在反恐怖主义、反间谍等特定领域，相关法律法规可能规定了行政机关在特定条件下的搜查权力。但即便如此，这些搜查活动也必须遵循严格的法律程序和规定，确保公民的合法权益不受侵犯。

3. 法律程序和保障：

   • 如果行政机关认为有必要进行搜查，通常应当向司法机关申请搜查证，并遵循司法机关的审查和批准程序。这样可以确保搜查活动的合法性和正当性，同时保护公民的合法权益。
   • 在搜查过程中，行政机关应当严格遵守法律程序和规定，如出示搜查证、告知搜查目的和范围、保护公民的隐私和财产安全等。如果行政机关违反法律程序和规定进行搜查，可能会面临法律责任和行政处罚。

4. 公民的权利和救济途径：

   • 公民在面对行政机关的搜查活动时，有权要求行政机关出示搜查证和相关法律文书，并有权拒绝非法搜查。如果公民认为行政机关的搜查活动侵犯了其合法权益，可以向相关部门投诉或寻求法律救济。
   • 例如，公民可以向行政机关的上级部门或监察机关投诉行政机关的违法行为，或者通过行政诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

总结与建议：在行政案件中，行政机关一般不可以直接开具检查证进行搜查。如果行政机关认为有必要进行搜查，应当遵循严格的法律程序和规定，向司法机关申请搜查证。公民在面对行政机关的搜查活动时，有权要求行政机关出示相关法律文书，并有权拒绝非法搜查。如果公民认为自己的合法权益受到侵犯，可以向相关部门投诉或寻求法律救济。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。