在解答您关于廉政协议书应盖单位公章还是合同专用章的问题时，我们首先要明确的是，廉政协议书作为一种具有法律效力的文件，其盖章的选择应基于文件的性质、用途以及相关法律法规的规定。
一、廉政协议书的性质与用途
廉政协议书通常是在采购、服务等项目合同中，为加强廉政建设、规范双方活动、防止不正当利益获取而订立的。它作为项目合同的重要组成部分，与主合同具有同等的法律效力。因此，廉政协议书的盖章应体现出其正式性和权威性。
二、单位公章与合同专用章的区别
单位公章：是单位对外行使权力的标志，具有最高的法律效力。它通常用于单位的重要文件、合同、证明等，以证明文件的真实性和合法性。
合同专用章：是单位专门用于签订合同的印章，其法律效力主要限于合同领域。它表明单位对合同内容的认可和承诺。
三、廉政协议书应盖的印章
考虑到廉政协议书的性质和用途，以及单位公章与合同专用章的区别，我们可以得出以下结论：
廉政协议书应盖单位公章。因为廉政协议书不仅涉及合同内容，更关乎单位的廉政建设和声誉。使用单位公章可以更好地体现单位对廉政协议书的重视和承诺，增强其法律效力和权威性。
合同专用章虽然也可用于合同相关文件，但在廉政协议书这种具有特殊性质的文件上，使用单位公章更为合适。因为单位公章的使用范围更广，更能体现单位的整体意志和权威。
四、实际操作建议
在实际操作中，建议您在签订廉政协议书时，明确要求使用单位公章进行盖章。同时，也可以咨询法律专业人士或单位法务部门的意见，以确保廉政协议书的合法性和有效性。
综上所述，廉政协议书应盖单位公章，以体现其正式性、权威性和法律效力。希望这一解答能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律咨询，请随时告知。