结论：司机被留置三个月后出来，并不意味着就完全没事了。留置的结束只是调查程序的一个阶段，后续是否会有进一步的法律后果，取决于调查的结果以及相关证据的收集情况。

分析说明：

1. 留置的性质与目的：

   • 留置是监察机关在调查涉嫌严重职务违法或职务犯罪时，对被调查人采取的一种限制人身自由的强制措施。其目的在于确保调查的顺利进行，防止被调查人逃避或干扰调查。
   • 留置期间，监察机关会对被调查人进行讯问、询问证人、调取证据等调查活动，以查明事实真相。

2. 留置结束后的可能情况：

   • 调查无果或证据不足：如果调查结束后，监察机关认为没有足够的证据证明被调查人存在违法或犯罪行为，或者调查无果，那么被调查人可能会被释放，且不会受到进一步的法律追究。但这并不意味着完全“没事”，因为如果后续有新证据出现，仍可能面临重新调查或起诉的风险。
   • 调查发现违法或犯罪行为：如果调查结束后，监察机关掌握了足够的证据证明被调查人存在违法或犯罪行为，那么被调查人可能会面临进一步的法律后果，如被移送检察机关审查起诉、被判处刑罚等。

3. 留置与后续法律程序的关系：

   • 留置只是调查程序的一部分，其结束并不意味着整个法律程序的结束。即使被调查人被释放，如果后续有新证据或新情况出现，仍可能面临重新调查或起诉。
   • 如果被调查人被移送检察机关审查起诉，那么将进入刑事诉讼程序，面临更严格的法律审查和可能的刑罚。

法律建议：

• 保持谨慎与配合：如果司机或其家属面临此类情况，应保持谨慎态度，积极配合监察机关的调查工作。同时，可以寻求专业律师的帮助，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
• 关注后续发展：留置结束后，应密切关注后续的法律发展，如是否收到检察机关的起诉书、是否需要参加庭审等。如有需要，应及时咨询律师并做好应对准备。

后续行动依据：

• 根据《中华人民共和国监察法》的相关规定，留置是监察机关在调查涉嫌严重职务违法或职务犯罪时采取的一种强制措施。留置的结束并不意味着调查的结束或法律责任的免除。
• 如果后续有新证据或新情况出现，监察机关或检察机关仍可能对被调查人进行重新调查或起诉。因此，被调查人及其家属应保持警惕，并随时准备应对可能的法律后果。

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