公务员违规经商，其违法所得通常会被没收。以下是对此问题的详细解析：
一、法律依据与处理原则
根据《中华人民共和国公务员法》以及《行政机关公务员处分条例》的相关规定，公务员不得违反规定从事或参与营利性活动，包括违规经商办企业。对于公务员违规经商所获得的收益，应依法予以没收，这是处理此类违规行为的基本原则之一。
二、具体处理措施
没收违法所得：
- 公务员违规经商所获得的经济利益，无论大小，均属于违法所得。相关部门在查实后，有权依法进行没收，以维护法律的严肃性和公平性。
给予行政处分：
- 根据违规情节的严重程度，公务员还可能面临警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等行政处分。这些处分措施旨在告诫公务员认识错误，纠正行为，并防止类似违规行为的再次发生。
通报批评与后续影响：
- 在适当范围内对违规公务员进行通报批评，以起到警示作用。同时，受到处分的公务员在处分影响期内通常不得晋升职务和级别，且此违规经历可能影响其未来的职务晋升和岗位调整。
三、情节轻重与处理差异
情节较轻的：
- 对于情节较轻的违规经商行为，公务员可能仅受到警告、记过或记大过等较轻的处分，并可能被责令限期改正、没收违法所得等。但即便如此，这些处分也会对其职业生涯产生一定影响。
情节较重的：
- 对于情节较重的违规经商行为，公务员可能面临降级、撤职甚至开除等更严厉的处分。如果其行为还构成犯罪，还将依法追究刑事责任，面临更严重的法律后果。
四、实际案例与警示
- 公务员利用职权或职务上的便利从事营利性活动，不仅损害公共利益和社会公平正义，还可能对政府部门的公信力造成不良影响。例如，某公务员利用职务之便经营企业，并为企业谋取不正当利益。这种行为被发现后，该公务员不仅被开除公职，还被追究了法律责任，其违法所得也被全部没收。这一案例警示所有公务员必须严格遵守相关法律法规和纪律规定，不得从事任何违规的营利性活动。
五、建议与提醒
- 作为公务员，应时刻牢记自己的职责和使命，严格遵守法律法规和纪律规定，避免从事或参与任何营利性活动。
- 如果发现自己或他人存在违规经商行为，应及时向相关部门报告并配合调查处理，以维护法律的严肃性和公平性。
综上所述，公务员违规经商不仅可能面临违法所得被没收的法律后果，还可能受到严厉的行政处分和刑事处罚。因此，公务员应严格遵守相关规定，避免从事任何违规的营利性活动。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。