在审理阶段发现违纪事实证据不足时，通常有以下两种处理方式：
若证据不足但仍有补充调查可能性的：
- 根据《中国共产党纪律检查机关监督执纪工作规则》及相关党内法规，审理阶段若发现证据不足，可退回纪律审查部门补充调查。补充调查的目的是进一步收集、固定证据，以完善证据链条，确保违纪事实的认定有充分依据。
- 补充调查的期限一般有限制，纪律审查部门需在规定时间内完成调查并重新移送审理。若逾期未移送或证据仍不足，审理部门将根据现有证据情况作出相应处理。
若证据严重不足且无法补充的：
- 若现有证据无法证明违纪事实存在，审理部门应依据“疑罪从无”原则，作出不予认定违纪事实的结论。这意味着被审查人将不被追究违纪责任。
- 若违纪事实部分成立但证据不足，审理部门可对成立的部分予以认定，并对证据不足的部分不予认定或提出进一步调查的建议。这体现了审理工作的严谨性和公正性，确保不冤枉一个好人，也不放过一个违纪者。
额外说明：
- 在处理证据不足的情况时，审理部门应严格遵循法定程序，确保被审查人的合法权益不受侵害。例如，保障被审查人的陈述权、申辩权等，允许其提供反驳证据或说明情况。
- 审理部门还应注重证据的合法性、真实性和关联性审查，确保所采纳的证据符合法律规定和审理要求。对于非法证据或瑕疵证据，应依法予以排除或要求补充完善。
建议：
- 若您或您所在单位遇到类似情况，建议及时咨询专业律师或纪律审查部门，以获取更具体的法律指导和操作建议。
- 在处理违纪案件时，应注重证据的收集和固定工作，确保案件事实清楚、证据确凿，以维护纪律的严肃性和公正性。