结论前置：在货物买卖合同纠纷中，若双方签订的买卖合同属于无效合同，一般情况下不能适用善意取得制度，但在特定情形下，若合同仅因处分权缺失而无效且其他方面符合生效要件，同时满足善意取得的其他构成要件，则可能适用善意取得。

一、善意取得制度的基本含义与构成要件

善意取得，是指无权处分人将其占有的他人财产转让给第三人，如果受让人在取得该财产时系出于善意，并支付了合理价格且已完成交付或登记，则受让人依法取得该财产的所有权，原权利人丧失所有权。其构成要件通常包括：

1. 受让人受让财产时是善意的：即受让人在受让财产时不知道转让人无处分权，且无重大过失。
2. 以合理的价格转让：价格应根据转让标的物的性质、数量以及付款方式等具体情况，参考转让时交易地市场价格及交易习惯等因素综合认定。
3. 转让的财产已依照法律规定完成登记或交付：对于不动产，必须已经完成登记；对于动产，必须已经交付给受让人。

二、合同无效对善意取得的一般影响

依据《民法典》的相关规定，善意取得的前提之一是存在有效的转让合同。如果合同被认定为无效，那么整个交易行为自始不具有法律效力，缺乏合法有效的基础。因此，在一般情况下，合同无效将导致不能适用善意取得制度。例如，若买卖合同因违反法律、行政法规的强制性规定而被认定无效，即使受让人受让财产时是善意的，支付了合理价款且财产已交付，受让人也不能基于善意取得制度取得财产的所有权。

三、特定情形下的善意取得

然而，在某些特定情形下，即便合同因处分权缺失而无效，也有可能适用善意取得制度。这主要体现在以下几个方面：

1. 无权处分的合同效力特殊性：根据《最高人民法院关于审理买卖合同纠纷案件适用法律问题的解释》，当事人一方以出卖人在缔约时对标的物没有所有权或处分权为由主张合同无效的，人民法院不予支持。这意味着，在无权处分的买卖合同中，合同本身并不因无权处分而无效。
2. 满足善意取得的其他构成要件：在无权处分的背景下，如果受让人在受让时满足善意取得的其他要件（即受让人善意、合理价格、已完成交付或登记），则仍有可能取得标的物的所有权。这是因为善意取得制度的核心在于保护交易安全和善意第三人的利益，而非单纯依赖于合同的效力。
3. 排除其他根本性违法因素：如果合同是因其他根本性的违法因素（如违反公序良俗、恶意串通损害他人利益等）而无效，则不能适用善意取得。

四、实例分析

假设甲将从乙处借来的汽车卖给丙，若甲与丙之间的买卖合同因甲无处分权而原本可能面临效力问题，但丙在购买时不知道甲无处分权（即善意），支付了合理价款，并且甲已将汽车交付给丙（即完成了动产的交付）。在此情形下，如果合同仅仅是因为处分权缺失而可能面临效力问题，但其他方面（如主体资格、意思表示、内容合法性等）均符合合同生效要件，且同时满足善意取得的其他构成要件，那么丙就有可能基于善意取得制度取得汽车的所有权。

五、总结与建议

综上所述，合同无效时一般不能适用善意取得制度，但在特定情形下可能存在例外。在处理相关纠纷时，应综合考虑合同的效力、交易的具体情况以及善意取得的构成要件等因素进行判断。对于当事人而言，在签订合同时应确保合同的合法有效性，并在交易过程中保持谨慎和注意义务，以避免因合同无效而导致的法律风险。如果遇到相关纠纷，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。