若转账支票的公司付不了款，可采取以下措施来维护自身权益：

1. 确认原因并沟通：

   • 首先，与出票公司进行沟通，了解其无法付款的具体原因。可能是公司资金暂时周转困难、账户被冻结、支票信息填写错误等。通过沟通，可以明确问题的根源，为后续解决提供方向。

2. 行使票据追索权：

   • 根据《中华人民共和国票据法》的相关规定，持票人（即您或您的公司）在支票被拒绝付款时，有权向出票人（即支付支票的公司）行使追索权。
   • 您需要准备相关证据，如支票原件、退票理由书、与出票公司的沟通记录等，以证明您已依法行使付款请求权但遭到拒绝。
   • 随后，您可以向法院提起诉讼，要求出票公司支付支票金额及相应的利息、费用等。

3. 考虑其他法律途径：

   • 如果出票公司存在恶意拖欠、欺诈等行为，您还可以考虑向公安机关报案，追究其刑事责任。
   • 同时，如果出票公司有其他可供执行的财产，您可以在诉讼过程中申请财产保全，以确保判决能够得到有效执行。

4. 注意时效问题：

   • 根据票据法的规定，持票人对前手的追索权，自被拒绝承兑或者被拒绝付款之日起六个月内不行使而消灭。因此，您需要在规定的时间内行使追索权，以免丧失权利。

在处理此类问题时，还需注意以下事项：

• 保留证据：确保所有与支票相关的文件、记录都得到妥善保存，以便在需要时提供证明。
• 及时行动：一旦发现支票无法兑现，应尽快采取行动，避免错过时效或给对方更多转移财产的机会。
• 咨询专业意见：虽然我可以为您提供一般性的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在处理复杂或涉及较大金额的案件时，建议您进一步向我详细咨询，以便获得更具体、更专业的指导。