结论：林地上当事人已经拆除违法建筑后，林业部门是否可以立案，需根据具体情况判断，包括违法行为的性质、拆除时间、是否造成损害以及林业部门是否已掌握足够证据等因素。

详细分析：

1. 违法行为的性质与立案条件：

   • 林业部门立案通常基于违法行为的存在及其性质。如果当事人在林地上建设的建筑本身属于违法建筑，且该行为违反了林业相关法律法规（如未经批准擅自占用林地、改变林地用途等），那么林业部门在发现或接到举报后，有权进行调查并决定是否立案。
   • 拆除违法建筑的行为本身，并不直接决定林业部门是否立案。关键在于拆除前违法行为是否已构成，以及林业部门是否已掌握足够证据证明违法行为的存在。

2. 拆除时间与立案的关系：

   • 如果当事人在林业部门介入调查或立案前已自行拆除违法建筑，且林业部门未掌握足够证据证明违法行为曾存在，那么林业部门可能因缺乏证据而无法立案。
   • 如果当事人在林业部门介入调查或立案后拆除违法建筑，这并不影响林业部门对之前违法行为的立案和处罚。拆除行为可能作为从轻或减轻处罚的情节考虑，但不影响立案的合法性。

3. 是否造成损害与立案：

   • 林业部门在决定是否立案时，还会考虑违法行为是否对林地资源造成了实际损害。如果拆除违法建筑后，林地资源已得到恢复或未造成严重损害，林业部门可能根据具体情况决定是否立案或采取其他措施。
   • 然而，即使林地资源未受到严重损害，如果违法行为本身性质严重（如涉及大量林地、长期占用等），林业部门仍可能立案并依法处罚。

4. 林业部门已掌握足够证据：

   • 林业部门在决定是否立案时，必须确保已掌握足够证据证明违法行为的存在。这些证据可能包括现场勘查记录、照片、视频、证人证言等。
   • 如果林业部门在当事人拆除违法建筑前已掌握足够证据，那么即使建筑已被拆除，林业部门仍可立案并依法处罚。

法律建议：

• 如果您是当事人，且已拆除林地上的违法建筑，建议主动向林业部门说明情况，配合调查，并尽可能提供拆除前后的照片、视频等证据，以证明您已积极纠正违法行为。
• 如果您是林业部门工作人员，在决定是否立案时，应全面考虑违法行为的性质、拆除时间、是否造成损害以及是否已掌握足够证据等因素，确保立案决定的合法性和合理性。

可能法律后果：

• 如果林业部门决定立案并依法处罚，当事人可能面临罚款、恢复林地原状、没收违法所得等处罚措施。
• 如果当事人对林业部门的处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

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