结论：在编人员名下有公司，选择注销还是变更，需根据具体情况综合考量，包括公司的经营状况、在编人员的职业规定以及未来规划等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、考虑因素
公司经营状况：
- 如果公司经营不善，长期亏损，且没有改善的可能，那么注销公司可能是一个合理的选择。注销可以彻底结束公司的法律存在，避免进一步的财务和法律责任。
- 如果公司仍有发展潜力，或者只是暂时遇到困难，那么变更公司结构或股权可能更为合适。例如，可以通过股权转让、增资扩股等方式调整公司股权结构，以适应新的经营需求。
在编人员职业规定：
- 在编人员通常受到较为严格的职业规定和纪律约束。如果其名下的公司与其本职工作存在利益冲突，或者违反了相关职业规定，那么注销公司可能是必要的，以避免潜在的职业风险和法律责任。
- 如果公司经营与在编人员的本职工作无直接关联，且符合相关职业规定，那么变更公司结构或股权可能更为可行，以保留公司的经营价值。
未来规划：
- 在编人员应考虑其未来的职业规划和发展方向。如果计划继续从事本职工作，且公司经营可能对其产生负面影响，那么注销公司可能是更好的选择。
- 如果计划利用公司平台开展其他业务或投资，那么变更公司结构或股权可能更为合适，以便更好地利用公司资源和发展机会。
二、注销与变更的具体操作
注销公司：
- 注销公司需要按照相关法律法规的规定进行清算、注销登记等程序。这通常包括成立清算组、通知债权人、清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、制定清算方案、办理注销登记等步骤。
- 注销过程中可能涉及税务、工商、银行等多个部门的协调和处理，需要耗费一定的时间和精力。
变更公司：
- 变更公司结构或股权通常涉及股权转让、增资扩股、公司合并或分立等程序。这些程序也需要遵循相关法律法规的规定，并办理相应的变更登记手续。
- 变更过程中可能需要与股东、债权人等相关方进行协商和谈判，以达成变更协议并确保变更的合法性和有效性。
三、法律建议
- 咨询专业意见：在做出决定前，建议咨询专业的法律或财务顾问，以了解注销或变更公司的具体法律程序和可能涉及的法律风险。
- 评估风险与收益：全面评估注销或变更公司的风险与收益，包括财务成本、时间成本、法律风险以及未来可能的发展机会等。
- 遵守法律法规：无论选择注销还是变更公司，都应确保遵守相关法律法规的规定，避免违法违规行为带来的法律责任和声誉损失。
最后，在编人员名下有公司时选择注销还是变更，是一个需要综合考虑多方面因素的决策过程。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。