村医遇到村民违法开药时，应立即停止开药行为，并视情况采取报告、留存证据、配合调查等措施，同时注意保护自身权益。具体分析如下：

1. 立即停止开药行为
   村医作为医疗从业者，首要职责是遵守《执业医师法》《药品管理法》等法律法规。若发现村民要求违法开药（如超量、无处方开药、开管制药品等），必须明确拒绝并停止操作，避免因“协助违法”承担连带责任。例如，若村民要求开具精神类药品但无合法手续，村医若违规开具可能涉嫌“非法提供麻醉药品、精神药品罪”。

2. 向相关部门报告
   根据《药品管理法》第119条，村医发现药品违法行为（如村民倒卖药品、伪造处方等），应及时向当地卫生健康部门、市场监管部门或公安机关报告。报告时需提供具体线索（如村民姓名、开药时间、药品名称等），并保留书面记录（如报告回执），以证明自身已履行法定义务。

3. 留存证据，保护自身
   若村民因被拒绝开药而威胁或诬告村医，村医需立即固定证据：

   • 书面记录：详细记录事件经过（时间、地点、对话内容）、村民要求及自身回应；
     
   • 证人证言：若有其他村民或工作人员在场，可请其作证；
     
   • 监控录像：若诊所有监控，及时保存相关片段；
     
   • 沟通记录：若通过电话、微信等沟通，保留聊天记录或通话录音。
     这些证据可在后续纠纷中证明村医无过错，避免被误认为“不作为”或“违规操作”。

4. 配合调查，如实陈述
   若相关部门介入调查，村医需积极配合，如实说明情况。根据《刑法》第307条，若村医在调查中故意隐瞒或伪造证据，可能构成“帮助毁灭、伪造证据罪”，需承担刑事责任。因此，务必保持诚实，避免因“包庇”或“掩盖”引发更大法律风险。

5. 特殊情况处理

   • 村民威胁或报复：若村民因被拒绝开药而威胁村医人身安全，村医可立即报警，并依据《治安管理处罚法》第42条追究其责任；若造成人身伤害，可追究其刑事责任（如故意伤害罪）。
     
   • 村医被误认违规：若村民或第三方诬告村医违法开药，村医可依据《民法典》第1165条提起民事诉讼，要求对方停止侵害、赔礼道歉并赔偿损失；若情节严重，可追究其诽谤罪（刑事责任）。

总结：村医在遇到村民违法开药时，需以“拒绝-报告-留证-配合”为原则，既履行法定义务，又保护自身权益。若遇到复杂情况（如村民纠缠、诬告等），可进一步向我咨询具体应对策略。