工程项目中甲乙双方签订的意向合同是具有法律效果的，但具体效果取决于意向合同的内容和双方的实际行为。以下是对这一问题的详细分析：
一、意向合同具有法律效力的情况
具备合同主要条款且有受约束的意思表示：
- 如果意向合同中明确列出了当事人的名称或姓名、住所、标的、数量等合同的主要条款，并且双方在合同中明确表示受其约束，那么该意向合同可能被认定为具有法律效力的合同。例如，在工程项目中，甲乙双方签订的《合作意向合同》中详细约定了工程范围、工期、价款等关键要素，并声明此意向合同对双方具有法律约束力，那么这份意向合同实际上已经具备了建设工程施工合同的主要要素，具有法律效力。
一方履行主要义务且对方接受：
- 根据《民法典》的相关规定，即使合同未采用书面形式，但一方已经履行了主要义务，且对方接受这一履行，那么该合同即被视为成立并具有法律效力。在工程项目中，如果一方已经按照意向合同的约定开始进行前期准备或施工工作，而另一方不仅知晓且未反对，还提供了必要的协助，那么这份意向合同就可能因为实际履行而被赋予法律效力。
包含特定法律约束力的条款：
- 意向合同中若明确规定了保密协议、排他性合作条款或违约金等具有法律约束力的特定条款，这些条款即便在意向合同框架下也可能产生独立的法律效力。在工程项目中，如果意向合同中包含了保密条款，要求双方对工程信息保密，那么这一条款就具有法律约束力，违反者可能需要承担法律责任。
后续正式合同中的引用与确认：
- 如果双方在后续的正式合同中引用了意向合同的内容，并且没有提出任何异议，那么这部分被引用的内容也可能被视为有效，并纳入正式合同的法律框架内。在工程项目中，如果甲乙双方在后续签订正式的建设工程施工合同时，引用了意向合同中的部分条款，并明确表示这些条款继续有效，那么这些条款就具有法律效力。
二、意向合同不具有法律效力的情况
仅表达合作意愿无具体权利义务：
- 如果意向合同仅仅表达了双方合作的初步意向，而未明确具体的权利义务内容，那么它通常被视为一种磋商性文件，不具备法律上的强制执行力。在工程项目中，如果甲乙双方签订的《合作意向书》中仅提及双方有意就某工程项目开展合作，但缺乏实质性条款，如工程范围、工期、价款等，那么这份意向书通常不具有法律效力。
附条件但条件未成就：
- 如果意向合同中约定了生效条件，而这些条件最终未能成就，那么该意向合同将不生效。在工程项目中，如果意向合同中规定需完成尽职调查并经各自董事会批准后方能生效，但这些条件未得到满足，那么这份意向合同就无法律效力。
三、实际操作建议
明确条款内容：
- 在签订意向合同时，应尽可能明确具体的权利义务内容，包括工程范围、工期、价款、付款方式等关键要素，以减少后续纠纷的风险。
注明法律效力：
- 可以在意向合同中明确注明该合同是否具有法律约束力，以及哪些条款具有法律约束力，以避免双方对合同效力产生争议。
及时签订正式合同：
- 在意向合同签订后，双方应尽快就具体事项进行协商并签订正式合同，以确保合同的完整性和可执行性。
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综上所述，意向合同的法律效力并非一成不变，而是取决于其具体内容和双方的实际行为。因此，在处理意向合同时应谨慎对待，以确保自身权益得到有效保护。