结论：工厂要求开具流水、无犯罪证明以及社保缴纳相关证明是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 关于流水证明

   • 合法性分析：工厂要求员工提供流水证明，通常是为了核实员工的收入情况、工作经历真实性或者用于其他合理的商业目的（如确定薪酬水平、评估员工稳定性等）。如果这一要求与劳动合同的履行、工厂的合法管理需求直接相关，并且不违反法律法规的强制性规定，那么这一要求在法律上是合法的。
   • 注意事项：然而，工厂在要求提供流水证明时，应当确保这一要求不侵犯员工的隐私权。流水证明包含员工的个人财务信息，属于敏感信息范畴。工厂应当明确告知员工提供流水证明的目的，并确保这些信息仅用于合法、正当的目的，且不会被不当泄露或滥用。

2. 关于无犯罪证明

   • 合法性分析：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关规定，无犯罪记录证明是由公安机关出具的对申请人有无刑事犯罪记录的书面证明。工厂在招聘过程中要求员工提供无犯罪证明，通常是为了确保员工具备良好的道德品质和职业操守，降低内部安全风险。这一要求在法律上并不被禁止，但需注意其合理性和必要性。
   • 注意事项：工厂在要求提供无犯罪证明时，应当确保这一要求与招聘岗位的性质、职责紧密相关，且不构成对员工的歧视。例如，对于一些涉及安全、保密等特殊要求的岗位，要求提供无犯罪证明可能是合理的；但对于一般岗位，过度要求可能涉嫌侵犯员工的隐私权或就业权。

3. 关于社保缴纳证明

   • 合法性分析：社保缴纳证明是证明员工参加社会保险并缴纳相关费用的书面文件。工厂要求员工提供社保缴纳证明，通常是为了核实员工的社保缴纳情况，确保员工享受应有的社会保障待遇，或者用于其他合法的商业目的（如计算员工福利、评估员工稳定性等）。这一要求在法律上是合法的，因为社保缴纳是员工的法定义务，也是工厂作为用人单位的法定责任。
   • 注意事项：工厂在要求提供社保缴纳证明时，应当确保这一要求不违反法律法规的强制性规定，如不得要求员工提供虚假的社保缴纳证明，或者利用社保缴纳证明进行非法活动。同时，工厂也应当积极履行自己的社保缴纳义务，确保员工的合法权益得到保障。