结论：工伤认定后做伤残鉴定一般不影响工伤认定结果，二者是不同阶段且相互关联的程序，但具体是否会产生影响需分情况讨论。
工伤认定与伤残鉴定的关系
工伤认定是确定员工所受伤害是否属于工伤的行政程序，由社保部门根据《工伤保险条例》审查事故性质、劳动关系等要素，作出是否认定工伤的决定。而伤残鉴定（劳动能力鉴定）是在工伤认定结论生效后，由劳动能力鉴定委员会对工伤职工的伤残等级、生活自理能力等进行医学技术性评定，目的是确定赔偿标准。二者是递进关系：先认定工伤，再鉴定伤残，因此正常情况下伤残鉴定不会影响已生效的工伤认定结果。
可能产生影响的特殊情形
- 工伤认定未生效时申请鉴定：若工伤认定决定尚未作出（如仍在60日审查期内或处于行政复议/诉讼阶段），此时申请伤残鉴定可能因程序倒置被鉴定机构要求补充材料或暂缓受理，但不会直接推翻工伤认定结果。
- 鉴定材料与工伤认定事实冲突：例如工伤认定时描述为“左手骨折”，但鉴定时发现实际伤情为“右手骨折”，或伤情与事故关联性存疑（如陈旧伤），此时鉴定机构可能要求重新核查工伤认定事实，但最终是否影响需以社保部门或法院的判定为准。
- 鉴定结论反推工伤认定依据：若伤残等级鉴定中发现伤情与工伤认定时提交的诊断证明、病历等材料差异较大（如误诊、漏诊），可能间接引发对工伤认定合法性的质疑，但这种情况需通过行政复议或诉讼程序解决，而非鉴定本身直接影响。
医生的疑问可能指向的实务风险
医生询问“是否影响”可能是基于以下考量：
- 程序合规性：担心在工伤认定未完成时启动鉴定，导致程序瑕疵（如鉴定机构以“未认定工伤”为由拒收材料）；
- 证据一致性：若鉴定时提交的新材料（如复查病历）与工伤认定时的材料矛盾，可能被用人单位或社保部门质疑工伤真实性；
- 赔偿计算：伤残等级直接影响赔偿金额（如十级伤残约7个月工资），若鉴定时机不当（如伤情未稳定）可能导致等级偏低，需重新鉴定，但不影响工伤认定本身。
建议：
- 若工伤认定决定已生效（收到《认定工伤决定书》），可放心申请伤残鉴定，二者互不影响；
- 若工伤认定尚未完成，建议先等待认定结论，避免因程序问题延误鉴定；
- 鉴定时确保提交的材料（如病历、影像片）与工伤认定时的材料一致，若伤情有变化需提前与社保部门沟通说明；
- 对鉴定结论有异议的，可在收到结论15日内申请重新鉴定，但不影响工伤认定效力。
如有具体材料或程序疑问，可进一步向我提供细节，我会结合《工伤保险条例》及地方实施细则为您分析。