非法经营罪主要由公安机关的经济犯罪侦查部门（经侦部门）负责管辖。以下是对这一结论的详细阐述：
一、非法经营罪与经侦部门职责
非法经营罪是典型的破坏社会主义市场经济秩序的犯罪，它涉及未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或其他限制买卖的物品，以及买卖进出口许可证、进出口原产地证明等法律、行政法规规定的经营许可证或批准文件等违法经营活动。这类犯罪行为严重扰乱了市场秩序，因此，公安机关的经济犯罪侦查部门（经侦部门）被赋予了查处此类犯罪的职责。
二、具体管辖规定
地域管辖：
- 非法经营罪的案件一般由犯罪地的公安机关经侦部门管辖。这意味着，如果非法经营活动发生在某个地区，那么该地区的公安机关经侦部门就有权对该案件进行立案侦查。
- 如果犯罪嫌疑人居住地的公安机关管辖更为适宜，也可以由犯罪嫌疑人居住地的公安机关经侦部门管辖。这一规定考虑到了犯罪嫌疑人的居住地与犯罪行为发生地可能不一致的情况，为了更有效地打击犯罪，允许选择更适宜的管辖机关。
级别管辖：
- 一般的非法经营犯罪案件，通常由基层公安机关（区、县级）的经侦大队负责办理。这些案件往往涉及金额较小、情节相对较轻的非法经营活动。
- 对于重大、复杂或跨区域的非法经营犯罪案件，可能会由市级甚至省级公安机关的经侦部门直接办理或组织协调办理。这些案件往往涉及金额巨大、情节严重或影响广泛的非法经营活动，需要更高层级的公安机关进行查处。
三、其他相关部门的职责
虽然非法经营罪主要由公安机关的经侦部门负责管辖，但在案件的处理过程中，还涉及其他相关部门的职责：
人民检察院：
- 人民检察院在非法经营罪案件中行使重要的检察权，包括审查逮捕、审查起诉和法律监督等。公安机关在侦查过程中，若认为需要对犯罪嫌疑人进行逮捕，需将案件提请人民检察院审查。检察院会根据案件事实和法律规定，决定是否批准逮捕。公安机关侦查终结后，会将案件移送人民检察院审查起诉。检察院会对案件的事实、证据和法律适用进行全面审查，以决定是否向人民法院提起公诉。
人民法院：
- 各级人民法院对非法经营罪案件具有审判管辖权。法院会依据法律规定和事实证据，对被告人是否构成非法经营罪以及应判处的刑罚作出公正判决。
四、实际应用中的建议
公众发现涉嫌非法经营时：
- 应当及时向当地公安机关的经侦部门进行举报或报案。经侦部门将依据法律规定和程序对举报或报案进行调查处理，确保市场经济秩序的合法稳定。
企业和个人：
- 应遵守相关法律法规，避免涉足非法经营活动。非法经营不仅可能触犯法律并承担相应的法律责任，还可能对企业的声誉和长期发展造成严重影响。
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