针对项目已完成但审计发现承包人投标造假的情况，处罚需结合法律条款、合同约定及造假性质综合判定，具体分析如下：

1. 法律层面的处罚依据

• 《招标投标法》第五十四条：投标人以他人名义投标或弄虚作假骗取中标的，中标无效，处中标项目金额5‰-10‰的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他责任人处单位罚款数额5%-10%的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，取消其1-3年内参加依法必须招标项目的投标资格并公告。
• 《刑法》第二百二十四条（合同诈骗罪）：若造假行为涉及虚构事实、隐瞒真相骗取财物，且数额较大（通常2万元以上），可能构成刑事犯罪，处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

2. 合同层面的违约责任

• 合同解除权：若招标文件或合同中明确约定“投标造假构成根本违约”，发包人可单方解除合同，并要求承包人赔偿全部损失（包括直接损失、预期利益损失及审计费用等）。
• 违约金条款：若合同约定了造假行为的违约金，发包人可主张按约定支付；若违约金低于实际损失，可请求法院或仲裁机构增加赔偿。
• 质量保证条款：若造假导致工程质量不达标，发包人可要求承包人返工、修复或承担修复费用，并可能扣除质保金。

3. 行政监管层面的处罚

• 行政处罚：除《招标投标法》规定的罚款外，监管部门（如发改委、住建部门）可对承包人作出警告、通报批评、降低资质等级或吊销资质证书等处罚。
• 信用惩戒：造假行为可能被记入企业信用档案，影响其参与政府投资项目或公共资源交易的资格。

4. 实务操作建议

• 固定证据：立即封存投标文件、合同、付款凭证、审计报告等材料，必要时委托公证或司法鉴定。
• 协商解决：优先与承包人协商，要求其书面承认造假事实并签署赔偿协议，降低诉讼风险。
• 诉讼/仲裁：若协商无果，可依据合同仲裁条款或向法院起诉，主张解除合同、赔偿损失及违约金。
• 刑事报案：若造假金额巨大或存在团伙作案，可向公安机关经侦部门报案，追究刑事责任。

风险提示

• 时效性：行政处罚需在知道造假行为后2年内提出，刑事追诉时效为5年（数额巨大时为10年）。
• 举证责任：发包人需证明造假行为与中标结果的因果关系，以及实际损失金额。
• 反诉风险：承包人可能以“发包人未尽审查义务”为由抗辩，需提前准备反驳证据。

建议：立即委托律师介入，全面评估法律风险，制定“行政+民事+刑事”组合维权策略，最大限度挽回损失。如有进一步问题，可直接向我咨询具体操作方案。