核心结论：针对受刑罚过后执业医师资格未及时注销，多年后再注销的合理合法合情处理方式，需分情况讨论，具体如下：
合法性处理
- 依据法规：根据《中华人民共和国执业医师法》第十五条及第十七条，受刑事处罚者，其医师执业证书应当被注销。若未及时注销，卫生行政部门有权依法追责，但重点在于后续补救措施的合法性。
- 补救程序：首先，应主动向原注册的卫生行政部门（如省级卫生健康委员会）提交书面申请，说明未及时注销的原因（如信息滞后、个人疏忽等），并附上刑事处罚判决书、身份证明等材料。其次，配合卫生行政部门的调查，如提供相关证据证明未继续从事非法执业活动。最后，根据调查结果，接受可能的行政处罚（如警告、罚款等），但通常不会因此再次吊销资格（因已受刑事处罚）。
- 法律依据：依据《行政许可法》第七十条，行政许可有效期届满未延续的，行政机关应当依法办理注销手续。虽此处未直接涉及刑事处罚后的注销，但可引申为“法定注销情形出现后，行政机关有职责处理”。
合理性处理
- 主动报告：建议立即主动向卫生行政部门报告情况，避免被认定为“隐瞒不报”或“非法执业”，从而减轻可能的行政责任。
- 配合调查：积极配合卫生行政部门的调查，如提供执业记录、患者反馈等，证明未因未注销资格而损害患者权益或社会公共利益。
- 承诺不再犯：书面承诺未来严格遵守法律法规，不再发生类似情况，以体现悔过态度。
合情性处理
- 人文关怀：在处理过程中，可强调个人因刑事处罚已付出沉重代价，且多年未再从事医疗活动，对社会无危害，请求卫生行政部门在注销时考虑实际情况，给予一定的宽限期或简化程序。
- 社会贡献：若个人在受刑罚后有过社会贡献（如志愿服务、公益活动等），可提供相关证明，以展现其改过自新的态度，争取卫生行政部门的理解。
- 家庭因素：如因家庭特殊情况（如重病、经济困难等）导致未及时注销，可提供相关证明，请求卫生行政部门在处理时予以考虑。
综合建议：
- 立即行动：尽快向原注册的卫生行政部门提交注销申请，避免问题进一步恶化。
- 准备充分：收集并整理所有相关证据和材料，以支持注销申请的合法性和合理性。
- 保持沟通：与卫生行政部门保持密切沟通，及时了解处理进度和结果，并根据需要调整策略。
- 法律咨询：在处理过程中，如有需要，可随时向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。