结论：在父亲欠债180万且未写明还款日期和利息的情况下，已还款的90万是否算本金，需根据具体情况来判断，一般情况下，在没有特别约定的情况下，已还款项应优先冲抵本金。以下是对此问题的详细分析：

一、法律背景

1. 《中华人民共和国民法典》相关规定：

   • 根据《民法典》中关于借款合同的规定，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。若合同中未明确约定还款顺序、利息计算方式等，则需依据法律规定或交易习惯来确定。
   • 在没有特别约定的情况下，借款人偿还的款项通常应首先冲抵本金，若本金冲抵完毕后仍有余额，再冲抵利息或其他费用。

2. 交易习惯与公平原则：

   • 在民间借贷中，若双方未明确约定还款顺序，通常会遵循交易习惯或公平原则来处理。即，借款人偿还的款项应优先用于偿还本金，以减轻借款人的负担。

二、具体情况分析

1. 无特别约定的情况：

   • 若父亲与债权人之间未签订书面借款合同，或合同中未明确约定还款顺序、利息计算方式等，则已还款的90万应优先冲抵本金。
   • 在此情况下，剩余未还的本金为90万（180万 - 90万），利息则需根据实际借款期限和双方约定的利率（若未约定，则可能按法定利率计算）来计算。

2. 有特别约定的情况：

   • 若父亲与债权人之间签订了书面借款合同，且合同中明确约定了还款顺序（如先还利息后还本金）或利息计算方式等，则已还款的90万可能需按照合同约定来处理。
   • 在此情况下，需仔细审查合同条款，以确定已还款项的具体性质（是本金还是利息）以及剩余未还款项的金额和性质。

三、法律建议

1. 审查借款合同：

   • 首先，应仔细审查父亲与债权人之间签订的借款合同（如有），以确定合同中是否明确约定了还款顺序、利息计算方式等关键条款。

2. 与债权人协商：

   • 若合同中未明确约定或约定不明确，建议与债权人进行协商，以达成一致意见并明确剩余未还款项的金额和性质。

3. 寻求法律帮助：

   • 若双方无法达成一致意见或存在争议，建议寻求专业律师的帮助，以通过法律途径解决纠纷并维护自身合法权益。

四、可能的法律后果

1. 若已还款项被认定为本金：

   • 则剩余未还的本金为90万，利息需根据实际借款期限和双方约定的利率（或法定利率）来计算。

2. 若已还款项被认定为利息或其他费用：

   • 则可能需继续偿还剩余本金及相应利息，且可能因未按时还款而承担违约责任（如支付违约金、罚息等）。

最后，在处理此类债务债权问题时，建议保持冷静并仔细审查相关证据和合同条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。