核心结论：当一个公司作为法人，而另一个公司作为其股东时，这构成了公司法中的法人股东结构，是合法且常见的商业安排。以下是对此情况的详细分析：

1. 法人股东结构的合法性：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司作为法人实体，有权成为其他公司的股东。这种结构在商业实践中非常普遍，有助于实现资本的集中、风险的分散以及资源的优化配置。

2. 法人股东的权利与义务：

   • 权利：作为股东，法人公司享有参与公司决策、分享公司利润、优先认购新股等权利。这些权利通过股东会或股东大会行使，具体取决于公司的章程和治理结构。
   • 义务：法人股东需履行出资义务，确保按时足额缴纳所认购的股本。同时，作为股东，还需遵守公司章程，不干预公司日常经营（除非通过合法程序行使股东权利），并承担公司亏损时的有限责任。

3. 法人股东与公司法人的关系：

   • 法人股东与公司法人之间是投资与被投资的关系。法人股东通过持有公司股份，成为公司的一部分所有者，但并不直接参与公司的日常经营管理（除非担任董事或高级管理人员）。
   • 公司法人作为独立法律实体，拥有自己的财产、名称、组织机构和住所，能够独立承担民事责任。法人股东的存在不影响公司法人的独立性和法律地位。

4. 潜在的法律风险与防范：

   • 关联交易风险：法人股东与公司法人之间可能存在关联交易，需确保交易价格公允、程序合法，避免利益输送和损害公司及其他股东利益。
   • 信息披露义务：作为上市公司或需公开披露信息的公司，法人股东需履行信息披露义务，确保市场透明度和投资者权益。
   • 合规经营：双方均需遵守相关法律法规，包括但不限于公司法、证券法、税法等，确保经营活动的合法性和合规性。

5. 实际操作建议：

   • 完善公司章程：明确法人股东的权利与义务、股东会或股东大会的议事规则等，为双方合作提供法律保障。
   • 建立有效治理结构：确保公司法人拥有独立的决策机构和监督机制，防止法人股东过度干预公司经营。
   • 加强风险管理：定期对关联交易进行审计和评估，确保交易合规性和公允性；加强信息披露管理，提高市场透明度。

总结与建议：公司作为法人成为另一公司的股东是合法且常见的商业安排。在此结构下，双方需明确各自的权利与义务，建立有效的治理结构和风险管理机制，以确保合作顺利进行并降低潜在法律风险。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。