汽车修理厂员工损坏车辆时，赔偿责任的承担需根据具体情况区分，核心结论如下：

1. 员工故意或重大过失导致损坏
   若员工因故意（如恶意破坏）或重大过失（如严重违反操作规程）导致车辆损坏，修理厂需承担全部赔偿责任，但可事后向员工追偿。

   • 法律依据：根据《民法典》第1191条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任；用人单位承担侵权责任后，可向有故意或重大过失的工作人员追偿。
     
   • 实务建议：修理厂应保留监控录像、操作记录等证据，证明员工存在故意或重大过失，以便后续追偿。

2. 员工一般过失导致损坏
   若员工因一般过失（如操作不熟练但非故意违规）导致损坏，赔偿责任通常由修理厂承担，员工无需个人赔偿。

   • 法律依据：员工在执行工作任务过程中造成的损害，属于职务行为，应由用人单位对外承担责任。
     
   • 例外情形：若修理厂与员工在劳动合同中明确约定“一般过失需赔偿”，且赔偿金额合理（不超过员工月工资的20%），则可能部分转嫁风险。但此类条款需符合《劳动合同法》第26条关于“免除用人单位法定责任、排除劳动者权利”的无效情形规定，实务中存在争议。

3. 车辆已投保车损险时的处理
   若车辆已投保车损险，车主可优先向保险公司申请理赔。保险公司赔付后，若损坏系员工故意或重大过失导致，保险公司可向修理厂追偿；修理厂再向员工追偿。

   • 实务建议：车主应第一时间联系保险公司定损，并保留修理厂员工损坏车辆的证据（如照片、视频、证人证言），以便后续维权。

4. 修理厂与车主的合同约定
   若修理厂与车主在维修合同中明确约定“损坏赔偿标准”（如按市场价赔偿、限额赔偿等），则优先按合同约定处理。但合同条款不得违反法律强制性规定（如免除修理厂故意或重大过失的责任）。

   • 风险提示：车主在签订维修合同时，应仔细阅读赔偿条款，避免因格式条款导致权益受损。

总结建议：

• 对车主而言：立即固定损坏证据（如拍照、录像），要求修理厂出具书面损坏说明，并协商赔偿方案；若协商不成，可向消费者协会投诉或直接起诉。
  
• 对修理厂而言：完善内部管理制度（如操作规范、监控覆盖），明确员工责任划分；购买雇主责任险或财产险，转移部分风险。
  

如有具体案件细节（如损坏原因、合同条款等），可进一步向我咨询，我会结合证据为您分析赔偿路径。