五个农民的农机合作社可以申请设施农用地，但需满足法定条件并履行审批程序。具体分析如下：

1. 主体资格符合性
   根据《土地管理法》及《自然资源部、农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》，设施农用地使用主体包括农村集体经济组织、农民合作社、农业企业等。农机合作社作为农民专业合作社的一种形式，属于法定适用主体，五个农民组成的合作社不影响其申请资格。

2. 用途限制与审批要求
   设施农用地需用于直接服务于农业生产的设施建设，例如：

   • 生产设施：温室、大棚、畜禽养殖圈舍等；
   • 附属设施：农业机械存放场所、农产品临时存储设施等。
     若合作社申请用地用于农机存放、维修或农产品初加工等配套服务，属于合法用途，但需向县级自然资源部门和农业农村部门备案或审批，具体流程因地区而异。

3. 面积与比例限制
   设施农用地面积需符合省级规定标准。例如，部分省份要求附属设施用地不超过项目用地总面积的5%-10%，且原则上不超过15亩。合作社需根据实际生产需求合理规划用地规模，避免超标占用。

4. 禁止性规定
   设施农用地不得用于非农建设（如住宅、商业开发），不得改变土地用途。若合作社违规将设施农用地用于非农活动，可能面临责令退还土地、拆除建筑物、罚款等行政处罚，甚至追究刑事责任。

操作建议：

1. 提前咨询当地自然资源部门，明确用地政策及审批流程；
   
2. 准备合作社章程、用地合同、项目规划图等材料；
   
3. 确保用地符合土地利用总体规划和乡镇国土空间规划；
   
4. 签订用地协议时明确土地复垦义务及期限。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体地区的政策细节或操作流程。