在发生医疗纠纷且患者死亡的情况下，是否结清出院费用需分情况讨论，具体分析如下：
一、医疗纠纷责任未明确前
法律原则：根据《民法典》侵权责任编及《医疗事故处理条例》的相关规定，医疗纠纷的责任认定需通过法定程序（如医疗事故鉴定、司法鉴定或法院判决）来确定。在责任未明确前，患者家属与医疗机构之间的费用结算问题，本质上属于民事合同关系与侵权责任关系的交叉领域。
建议做法：
- 协商处理：患者家属可与医疗机构协商，就费用结算达成临时协议。例如，双方可约定在责任明确前，先支付部分费用或暂缓支付，待责任明确后再行结算。
- 保留证据：无论是否结清费用，患者家属均应保留好所有医疗费用单据、病历资料等证据，以备后续维权之需。
潜在风险：若患者家属在责任未明确前擅自结清费用，可能面临后续维权时无法追回已支付费用的风险；反之，若拒绝支付费用，则可能面临医疗机构通过法律途径追讨欠费的风险。
二、医疗纠纷责任明确后
责任归属医疗机构：
- 费用承担：若医疗纠纷经鉴定或判决确认医疗机构存在过错，且该过错与患者死亡存在因果关系，则医疗机构应承担相应的赔偿责任。在此情况下，患者家属已支付的医疗费用中，属于医疗机构过错导致的部分，可要求医疗机构予以退还或抵扣赔偿款。
- 赔偿范围：根据《民法典》及《医疗事故处理条例》的规定，赔偿范围包括医疗费、丧葬费、死亡赔偿金、精神损害抚慰金等。患者家属可依据生效法律文书向医疗机构主张赔偿。
责任归属患者或第三方：
- 费用承担：若医疗纠纷经鉴定或判决确认医疗机构无过错，或患者死亡系由患者自身疾病、第三方行为等原因导致，则患者家属应承担全部医疗费用。在此情况下，患者家属已支付的医疗费用不予退还。
- 特殊情况：若患者家属认为医疗机构存在管理过失（如未及时救治、未履行告知义务等），但该过失与患者死亡无直接因果关系，则医疗机构可能需承担部分赔偿责任（如精神损害抚慰金），但医疗费用仍需由患者家属承担。
三、实务操作建议
- 及时咨询专业律师：医疗纠纷涉及复杂的法律问题和医学知识，患者家属在处理此类纠纷时，应及时咨询专业律师，以便准确判断责任归属、计算赔偿金额并制定维权策略。
- 参与医疗事故鉴定：医疗事故鉴定是认定医疗机构是否存在过错的重要依据。患者家属应积极参与鉴定程序，提供必要的证据材料，确保鉴定结果客观公正。
- 注意诉讼时效：根据《民法典》的规定，医疗纠纷的诉讼时效为三年。患者家属应在知道或应当知道权利受到侵害之日起三年内提起诉讼，否则将丧失胜诉权。
总结来说，在发生医疗纠纷且患者死亡的情况下，是否结清出院费用需根据责任归属来确定。患者家属在处理此类纠纷时，应保持冷静、理性，及时咨询专业律师并保留好相关证据材料，以便维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。