关于工程保修期内维修款由谁支付的问题，结论需根据具体情况及合同约定来确定，以下是详细分析：

1. 合同有明确约定的情况：

   • 如果建设工程施工合同中已经明确约定了保修期内维修费用的承担方式，那么双方应严格按照合同约定执行。例如，合同可能规定所有维修费用（包括材料费、人工费等）均由施工单位承担，或者根据故障原因按比例分担。

2. 合同未明确约定的情况：

   • 因工程质量问题导致的维修：根据《建设工程质量管理条例》等相关法规，施工单位对保修范围和保修期限内的质量问题承担保修责任。因此，如果维修是由于施工单位的施工质量问题导致的，那么维修费用（包括因此产生的其他相关费用，如征地费用等，若与维修直接相关）应由施工单位承担。
   • 非工程质量原因导致的维修：如果维修并非由于施工质量问题，而是由于建设单位的使用不当、第三方破坏或不可抗力等原因导致的，那么维修费用应由责任方承担。例如，如果是建设单位额外要求进行的维修，且该维修并非必要或非因施工质量问题引起，那么维修费用应由建设单位自行承担。

3. 特殊情况的考虑：

   • 保修金的性质与用途：保修金是建设单位在工程竣工验收合格后，按照合同约定从应付工程款中预留的一部分资金，用于保证施工单位在保修期内履行保修义务。如果保修金足以覆盖维修费用，那么可以直接从保修金中扣除；如果保修金不足，则超出部分应由责任方承担。
   • 维修的及时性与通知义务：在保修期内，建设单位应及时通知施工单位进行维修。如果建设单位未及时通知或未提供必要的维修条件，导致维修费用增加或损失扩大的，建设单位应承担相应责任。

法律建议：

• 审查合同条款：首先，双方应仔细审查建设工程施工合同中关于保修期、保修责任及维修费用承担的条款，以明确各自的权利和义务。
• 及时沟通协商：在出现维修需求时，双方应及时沟通协商，明确维修原因、责任方及费用承担方式，避免产生不必要的纠纷。
• 保留相关证据：双方应保留与维修相关的所有证据，如维修通知、维修记录、费用清单等，以便在发生纠纷时能够证明各自的主张。

可能产生的法律后果：

• 如果双方无法就维修费用承担达成一致意见，可能会引发合同纠纷。此时，双方可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决争议。
• 如果施工单位未按照合同约定履行保修义务或承担维修费用，建设单位有权要求施工单位承担违约责任，并可能因此遭受损失赔偿。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。