结论：交通事故中驾驶员负主要责任且伤者三个月后死亡，驾驶员是否需要承担刑事责任，取决于事故的具体情况、驾驶员的行为是否构成交通肇事罪以及死亡原因与交通事故之间的因果关系。若驾驶员已因事故死亡，则不再追究其刑事责任，但其遗产可能需承担民事赔偿责任。以下从多个角度进行详细分析：
一、刑事责任判定
法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑法》（2023修正）第一百三十三条，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
责任认定：
- 交通事故发生后，公安机关交通管理部门会进行调查，并根据调查结果确定事故责任。若驾驶员被认定为主要责任方，且其行为符合交通肇事罪的构成要件（如超速、酒驾、违规变道等导致事故发生），则将依法追究其刑事责任。
因果关系判断：
- 判断驾驶员的行为是否与伤者的死亡结果存在刑法上的因果关系至关重要。这通常需要法医进行专业鉴定，以确定死亡原因是否直接由交通事故引起。如果伤者的死亡确实是由交通事故造成的伤害（如严重颅脑损伤、内脏破裂等）直接导致，即便是在事故发生三个月后，驾驶员也可能需要承担刑事责任。
二、特殊情况考虑
驾驶员死亡的影响：
- 如果驾驶员在事故发生后经治疗最终死亡，这一事实本身并不改变其在事故中的责任认定。然而，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，若犯罪嫌疑人或被告人已经死亡，将不再追究其刑事责任。
逃逸或其他恶劣情节：
- 若驾驶员在事故后立即逃逸，导致伤者无法得到及时救治而死亡，或存在其他特别恶劣情节（如酒驾、毒驾、无证驾驶等），驾驶员将面临更严厉的刑事处罚。
伤者自身因素或医疗事故：
- 如果伤者的死亡与其他因素（如自身疾病、医疗事故等）有直接关系，且这些因素对死亡结果起到了主要作用，那么驾驶员可能无需对死亡结果承担刑事责任。但这一判断需要基于专业的医疗鉴定和司法鉴定。
三、民事赔偿责任
赔偿范围：
- 无论驾驶员是否承担刑事责任，其遗产都可能需根据事故责任认定书承担相应的民事赔偿责任。赔偿范围可能包括死亡赔偿金、丧葬费、医疗费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、营养费、被抚养人生活费以及精神损失费等。
赔偿程序：
- 首先，保险公司将在第三者责任强制保险责任限额范围内进行赔付。若赔偿金额超出保险责任限额，则责任方的遗产将根据事故责任认定书来承担剩余的赔偿责任。
四、建议与行动
驾驶员方面：
- 保护现场、及时报警并救治伤者是非常重要的，这不仅是道德义务，也是避免不必要法律责任和纠纷的关键措施。
- 积极配合公安机关交通管理部门的调查，如实陈述事故经过，提供相关证据。
伤者家属方面：
- 了解相关法律法规，积极配合相关部门进行调查取证，以维护自身合法权益。
- 及时申请医疗鉴定和司法鉴定，以确定死亡原因与交通事故之间的因果关系。
- 在民事赔偿方面，可以与驾驶员的家属或保险公司进行协商，或通过法律途径解决争议。
综上所述，交通事故中驾驶员负主要责任且伤者三个月后死亡，驾驶员是否需要承担刑事责任需综合考虑多种因素。在处理此类案件时，应全面分析事故情况、责任认定及赔偿事宜，以确保法律的公正实施和受害者的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。