合同无效情形下，逾期交付工程损失的计算需结合过错责任、实际损失及因果关系综合判定，具体分以下情况处理：

1. 损失计算的核心原则：过错责任分担

根据《民法典》第157条，合同无效后，有过错的一方应赔偿对方因此受到的损失；双方均有过错的，按过错比例分担损失。

• 若因发包人原因导致合同无效（如未取得规划许可、未办理工程审批手续等），发包人需对逾期交付的损失承担主要责任，赔偿范围包括承包人因逾期产生的直接损失（如设备闲置费、人员窝工费）及合理间接损失（如预期利润损失需结合行业惯例判定）。
  
• 若因承包人原因导致合同无效（如无资质施工、转包违法分包等），承包人需赔偿发包人因逾期交付导致的损失，如租金损失、商业机会损失等，但需以发包人实际损失为限，且需证明损失与逾期交付的直接因果关系。
  
• 双方均有过错（如发包人未审批且承包人无资质），按过错比例分担损失，例如发包人承担60%、承包人承担40%。

2. 损失的具体计算方法

（1）直接损失的认定

• 承包人损失：包括已投入的人工、材料、机械费用（需提供合同、付款凭证等证据），以及因逾期导致的额外支出（如租赁设备延期费用、仓储费等）。
  
• 发包人损失：包括因工程逾期无法投入使用产生的租金损失（需提供租赁合同）、违约金支出（如向第三方赔偿的违约金）、商业机会损失（需证明实际损失金额，如预期收益减少的审计报告）。
  

（2）间接损失的认定

• 预期利润：若合同有效且可履行，承包人可主张预期利润，但合同无效时，法院通常不支持预期利润，除非能证明发包人明知合同无效仍诱导承包人投入（实践中认定严格）。
  
• 资金占用利息：若一方占用对方资金（如预付款、工程款），可主张按LPR计算的利息损失。
  

（3）举证责任

损失方需提供证据证明损失的实际发生及金额（如发票、合同、审计报告等），否则可能承担举证不能的不利后果。

3. 特殊情形：合同无效但工程验收合格

根据《建设工程司法解释一》第24条，若建设工程经竣工验收合格，承包人可参照合同约定主张工程价款，但逾期交付的损失仍需按过错责任分担。例如：

• 合同约定逾期违约金为日万分之五，但因合同无效，违约金条款无效，法院可能按实际损失（如租金损失）结合过错比例调整赔偿金额。

4. 实务建议

• 合同无效风险防范：签订合同前核查双方资质、审批手续，避免使用违法条款（如“垫资施工”“以审计结果为结算依据”等）。
  
• 损失证据固定：逾期发生后，及时通过书面函件、会议纪要、第三方评估等方式固定损失金额及因果关系。
  
• 协商优先：合同无效后，双方可协商赔偿比例，避免诉讼成本（如鉴定费、律师费）。
  

提示：具体案件需结合合同条款、过错程度、损失证据综合判定，建议提供详细材料进一步分析。