结论：合同中约定EXW（工厂交货）术语，但实际由卖方报关，这种情况在法律和国际贸易惯例上并非绝对禁止，但可能涉及合同条款的变更或补充，以及双方权利义务的调整。以下从多个角度进行详细分析：

1. EXW术语的基本含义：

   • EXW，即“Ex Works”，意为工厂交货。在此术语下，卖方在其所在地或其他指定的地点（如工厂、工场或仓库）将货物交给买方处置时，即完成交货。卖方不负责将货物装上买方安排的运输工具，也不负责办理出口清关手续。

2. 实际由卖方报关的情况分析：

   • 合同条款的变更或补充：如果合同中明确约定了EXW术语，但双方又在实际操作中约定由卖方负责报关，这实际上是对原合同条款的变更或补充。在这种情况下，双方应签订书面协议或补充合同，明确卖方的报关义务以及由此产生的费用承担等问题。
   • 双方协商一致：即使合同中没有明确约定由卖方报关，但如果双方在实际操作中达成了一致意见，且该意见不违反法律法规的强制性规定，那么这种安排也是有效的。然而，为了保障双方的权益，建议将协商结果以书面形式固定下来。
   • 卖方自愿承担额外义务：卖方可能出于各种原因（如提高客户满意度、促进交易等）自愿承担报关义务。在这种情况下，卖方应确保自己具备报关的能力和资质，并了解相关法律法规和报关流程，以避免因报关不当而引发的法律风险。

3. 可能涉及的法律风险：

   • 合同违约风险：如果合同中明确约定了EXW术语，且未约定由卖方报关，而卖方却擅自报关，可能构成对合同条款的违反，从而面临合同违约的风险。
   • 报关不当风险：如果卖方不具备报关的能力和资质，或者对报关流程不熟悉，可能导致报关不当，进而引发海关处罚、货物滞留等法律风险。
   • 费用承担风险：如果双方未就报关费用承担问题达成一致意见，可能导致费用承担纠纷。

4. 法律建议：

   • 明确合同条款：在签订合同时，双方应明确约定交货术语、报关义务以及费用承担等问题，以避免后续纠纷。
   • 签订补充协议：如果双方在实际操作中需要对原合同条款进行变更或补充，应签订书面协议或补充合同，并明确双方的权利义务。
   • 了解法律法规：双方应了解并遵守相关法律法规和报关流程，以确保交易的合法性和顺利进行。

总结与进一步思考：合同中约定EXW术语但实际由卖方报关的情况，需要双方根据实际情况进行协商和安排。为了保障双方的权益和避免法律风险，建议双方在合同中明确约定相关条款，并在实际操作中遵守相关法律法规和报关流程。如果你在实际操作中遇到了相关问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。