农民工垫资购买的材料款一般不算工资，但需分情况讨论，具体分析如下：

1. 垫资款与工资的法律性质不同
   工资是用人单位依据劳动合同约定，以货币形式支付给劳动者的劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴等。而垫资款是劳动者为完成工作任务预先支付的费用，属于“债权债务关系”，需通过报销流程由用人单位返还，与工资的劳动报酬性质有本质区别。

2. 垫资款可能被认定为工资的例外情形
   若用人单位与农民工约定“垫资款包含在工资总额中”，或通过书面协议明确将材料款作为工资组成部分（例如约定“月工资包含垫资款5000元”），则可能被认定为工资。但此类约定需满足：

   • 双方自愿签署书面协议；
     
   • 工资总额不低于当地最低工资标准；
     
   • 用人单位未通过其他方式克扣或拖欠工资。
     若不符合上述条件，司法实践中可能仍将其视为独立债权。

3. 实务中的风险与建议

   • 对农民工：保留垫资凭证（如发票、收据、转账记录），要求用人单位出具书面报销承诺；若垫资款被拖欠，可依据《保障农民工工资支付条例》主张权利，但需区分“工资”与“垫资款”的请求权基础。
     
   • 对用人单位：避免将垫资款与工资混同，建议通过专项报销制度处理材料款，防止被认定为“未足额支付工资”而承担法律责任（如加付赔偿金）。

总结：垫资款与工资在法律上独立存在，但双方可通过约定改变其性质。若您遇到具体纠纷，可提供合同、付款记录等材料，我将进一步分析法律风险及维权路径。