政府强制收回土地时，地上在建工程的处理需根据具体情形，结合法律法规及政策综合判断，核心处理方式如下：
- 依据土地收回的合法性及补偿原则处理
若政府因公共利益（如基础设施建设、城市规划调整等）依法收回土地，需根据《土地管理法》《国有土地上房屋征收与补偿条例》等规定，对地上在建工程给予合理补偿。补偿范围通常包括：
- 工程直接损失：已投入的建筑材料、人工费用、设备租赁费用等实际支出；
- 预期利益损失：若在建工程已取得合法审批手续（如规划许可、施工许可），且因收回导致无法继续建设，可能需补偿预期收益（需结合工程进度、市场价值等评估）；
- 搬迁费用：若工程需迁移至其他地块，可能涉及设备搬迁、临时安置等费用。
关键点：补偿需以“合法性”为前提，若在建工程本身存在违法建设（如未取得规划许可、超面积建设等），可能面临部分补偿或无补偿风险。
区分土地使用权性质处理
- 出让土地：若土地是通过出让方式取得，政府收回时需按照出让合同约定及《民法典》相关规定，退还剩余年限的土地出让金，并补偿地上附着物（包括在建工程）损失；
- 划拨土地：若土地为划拨取得（如公益项目用地），政府收回时可能无需退还土地出让金，但仍需对地上在建工程给予补偿，补偿标准可能低于出让土地。
在建工程权属争议的处理
若在建工程存在权属争议（如开发商与施工方、投资人之间的纠纷），政府收回时可能要求权利人先行解决争议，或直接将补偿款提存至法院或公证机构，待争议解决后分配。
行政强制程序中的注意事项
政府强制收回土地需严格履行法定程序，包括：
- 发布征收公告并说明理由；
- 组织听证或协商补偿方案；
- 作出补偿决定并送达权利人；
- 权利人未履行搬迁义务的，方可申请法院强制执行。
风险提示：若政府未履行法定程序直接强制拆除在建工程，可能构成行政违法，权利人可依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求确认强制行为违法并主张赔偿。
建议：若您面临此类问题，需第一时间固定证据（如土地使用权证、规划许可、施工合同、投入凭证等），并委托律师对政府收回行为的合法性、补偿方案的合理性进行审查，必要时通过法律途径维护权益。