您好，关于“执业药师证在诊所执业是否合法”的问题，我可以为您详细解答。

首先，我们需要明确执业药师和诊所的执业范围及要求。执业药师是在药品生产、经营、使用和其他需要提供药学服务的单位中执业的药学技术人员，其执业资格证由人力资源社会保障部统一印制，国家药监局与人力资源社会保障部用印。而诊所，作为医疗机构的一种，其执业需要获得相应的《医疗机构执业许可证》或《诊所备案凭证》。

接下来，我们分析执业药师在诊所执业的合法性。根据相关规定，执业药师的执业范围包括药监部门管理的社会药店、医药公司等，但并未明确排除诊所。实际上，在诊所中，如果涉及到药品的调配、使用和管理等药学服务，那么执业药师的存在是非常必要的。而且，从上海市药品监督管理局的回复中我们可以了解到，执业单位合法开业证明包括《医疗机构执业许可证》和《诊所备案凭证》，这也间接说明了执业药师在诊所执业的合法性基础是存在的。

然而，要确定执业药师在诊所执业是否完全合法，还需要考虑诊所的具体类型和执业药师的具体职责。例如，如果诊所是中医诊所且主要开展中药饮片调剂活动，那么根据中医诊所的基本标准，至少需要有1名中药专业技术人员。在这种情况下，如果执业药师具备中药专业技术资格，那么其在诊所执业就是合法的。如果诊所是综合诊所或西医诊所，且执业药师负责药品的调配、使用和管理等药学服务，那么同样也是合法的。

但需要注意的是，执业药师在诊所执业时，必须确保其执业行为符合相关法律法规和规章制度的要求，如遵守药品管理法规、确保药品质量安全等。同时，诊所也需要为执业药师提供必要的执业条件和保障，如提供合适的执业场所、配备必要的药学设备和设施等。

综上所述，执业药师证在诊所执业是合法的，但前提是诊所必须获得相应的执业许可，且执业药师必须在其执业范围内从事药学服务活动。如果您有进一步的疑问或需要更具体的指导，请随时告诉我。