结论：借了网贷和第三方协商还本金后，公司不一定会自动给你开结清证明，这主要取决于协商的具体内容和公司的政策。以下从多个角度为你详细分析：

1. 协商内容的影响：

   • 如果你在与第三方协商时，明确约定了还款后公司需出具结清证明，并且这一约定被书面记录下来（如通过邮件、短信或书面协议等形式），那么公司有义务按照约定出具结清证明。
   • 如果协商内容中并未明确提及结清证明的事宜，或者只是口头约定，那么公司可能没有自动出具结清证明的义务。此时，你可以主动与公司沟通，要求其出具结清证明，以证明你已经履行了还款义务。

2. 公司政策的影响：

   • 不同的网贷公司可能有不同的政策。有些公司可能为了维护良好的客户关系，会主动在借款人还清本金后出具结清证明。
   • 而有些公司则可能出于成本考虑或其他原因，不会自动出具结清证明。在这种情况下，你需要主动与公司联系，了解其出具结清证明的具体流程和要求。

3. 法律建议：

   • 为了避免后续可能出现的纠纷，我建议你尽量在协商还款时，就结清证明的事宜与公司达成明确约定，并尽量将约定书面化。
   • 如果公司拒绝出具结清证明，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，你可以向当地消费者协会或相关监管部门投诉，或者寻求法律援助，通过诉讼等方式要求公司出具结清证明。

4. 可能的法律后果：

   • 如果你已经还清了本金，但公司拒绝出具结清证明，这可能会对你的信用记录产生一定影响。因为结清证明是证明你已经履行还款义务的重要文件，没有它，其他金融机构或个人可能无法确认你的还款情况。
   • 在极端情况下，如果公司恶意不出具结清证明，并因此给你造成了损失（如影响了你申请其他贷款或信用卡等），你还可以考虑通过法律途径要求公司承担相应的赔偿责任。

总结与进一步思考： 借了网贷和第三方协商还本金后，公司是否会自动出具结清证明并不是一个确定的问题。它取决于协商的具体内容、公司的政策以及可能涉及的法律后果。因此，我建议你在协商还款时，就结清证明的事宜与公司进行明确沟通，并尽量将约定书面化。如果公司拒绝出具结清证明，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。如果你还有其他关于金融保险或债务债权方面的问题，欢迎直接向我咨询。