结论：扰乱个体门店正常经营，报警后做了笔录，并不一定会留下案底。是否留案底，主要取决于后续的处理结果以及是否构成犯罪。
分析说明：
笔录与案底的关系：
- 笔录是警方在调查过程中记录当事人陈述或证人证言的书面材料，它是警方收集证据的一种方式。
- 案底，通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪行为被法院判决有罪后留下的记录。
- 仅仅因为做了笔录，并不意味着就会留下案底。笔录只是调查过程中的一个环节，它本身并不构成犯罪记录。
是否构成犯罪：
- 扰乱个体门店正常经营，如果情节轻微，可能只构成一般的治安违法行为，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，可能会受到警告、罚款或行政拘留等处罚，但不会留下犯罪记录。
- 如果扰乱行为情节严重，构成犯罪（如寻衅滋事罪、破坏生产经营罪等），那么经过法院审判后，就会留下犯罪记录，即案底。
后续处理结果的影响：
- 如果警方调查后认为不构成犯罪，或者虽然构成犯罪但情节轻微不予起诉，或者法院判决无罪，那么就不会留下案底。
- 如果警方调查后认为构成犯罪，并移送检察院起诉，最终法院判决有罪，那么就会留下案底。
特殊场景：
- 如果扰乱行为涉及未成年人，根据相关法律法规，对未成年人的犯罪记录可能会进行封存或保密处理，但这并不意味着没有案底，只是在特定条件下不公开。
建议与行动：
- 如果您或您的门店遭遇了扰乱正常经营的情况，首先应及时报警并配合警方的调查。
- 在调查过程中，如实陈述事实，提供相关证据，以便警方能够准确判断事件的性质。
- 如果后续收到警方的处理通知或法院的传票，应及时咨询专业律师（如我，董文宇律师，专注于合同纠纷、侵权纠纷领域），了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》和《中华人民共和国刑法》的相关规定，扰乱公共秩序、破坏生产经营等行为可能受到行政处罚或刑事处罚。
- 犯罪记录的管理和查询受到严格限制，只有特定机关在特定条件下才能查询和使用。
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