在围标串标案中，招标代理人员获利两千元，可能面临行政处罚、刑事处罚以及民事赔偿等法律后果，具体处理方式需根据案件实际情况和法律规定来确定。以下从不同法律角度进行详细分析：

1. 行政处罚角度：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条：“投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，投标人以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标的，中标无效，处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，取消其一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照；构成犯罪的，依法追究刑事责任。给他人造成损失的，依法承担赔偿责任。”
   • 招标代理人员作为招标活动的组织者或参与者，若参与围标串标并获利，即使获利金额仅为两千元，也可能被视为违法所得，面临没收违法所得以及罚款的行政处罚。罚款的数额将根据其违法行为的严重程度和具体情节来确定。

2. 刑事处罚角度：

   • 如果围标串标行为情节严重，构成了犯罪，如串通投标罪，那么招标代理人员可能面临刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》第二百二十三条：“投标人相互串通投标报价，损害招标人或者其他投标人利益，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。投标人与招标人串通投标，损害国家、集体、公民的合法利益的，依照前款的规定处罚。”
   • 尽管获利两千元可能不直接构成“情节严重”的唯一标准，但若该行为是串通投标犯罪的一部分，或者与其他严重情节相结合，招标代理人员仍可能面临刑事追责。

3. 民事赔偿角度：

   • 除了行政处罚和刑事处罚外，招标代理人员还可能因围标串标行为给招标人或其他投标人造成损失，而面临民事赔偿的责任。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
   • 在这种情况下，招标代理人员需要赔偿因其违法行为给招标人或其他投标人造成的直接经济损失，包括但不限于因重新招标而产生的费用、因中标无效而导致的合同损失等。

建议：对于招标代理人员而言，一旦涉及围标串标行为，无论获利多少，都应积极配合相关部门的调查，主动退还违法所得，并尽可能减轻违法行为的后果。同时，也可以寻求专业法律帮助，以更好地维护自己的合法权益。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。