在没经过股东允许的情况下擅自买卖股权，是否涉及刑事案件，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
民事纠纷层面：
- 股权转让通常需要遵循公司章程和相关法律法规的规定，包括但不限于股东会决议、优先购买权行使等程序。如果未经股东允许擅自买卖股权，首先可能面临的是民事纠纷，即其他股东或公司可能以侵犯其合法权益为由，向法院提起民事诉讼，要求确认股权转让无效、赔偿损失等。
刑事犯罪层面：
- 职务侵占罪：如果擅自买卖股权的行为人同时是公司管理人员或员工，且利用职务上的便利，将公司股权非法占为己有或转卖给他人，数额较大的，可能构成职务侵占罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。
- 背信损害上市公司利益罪：对于上市公司而言，如果上市公司的董事、监事、高级管理人员违背对公司的忠实义务，利用职务便利，操纵上市公司进行不正当、不公平的关联交易，致使上市公司利益遭受重大损失的，可能构成背信损害上市公司利益罪。虽然这一罪名直接针对的是上市公司，但类似的原则也可能适用于其他公司类型，在特定情境下作为参考。
- 其他犯罪：如果擅自买卖股权的行为还涉及伪造公司文件、诈骗等犯罪行为，那么行为人还可能面临其他相关罪名的指控。
综合判断：
- 是否构成刑事犯罪，需要综合考虑行为人的身份、行为方式、行为后果以及主观故意等多个因素。如果行为人只是出于个人目的，未经股东允许擅自买卖股权，但并未利用职务便利或伪造文件等手段，且未造成严重后果的，可能仅构成民事纠纷，而不涉及刑事犯罪。
- 如果行为人的行为符合上述刑事犯罪的构成要件，且经司法机关认定，那么行为人将面临刑事责任的追究。
建议：
- 对于公司而言，应建立健全的股权管理制度，明确股权转让的程序和要求，防止未经股东允许擅自买卖股权的情况发生。
- 对于股东而言，应密切关注公司的股权变动情况，及时行使自己的股东权利，维护自己的合法权益。
- 如果发生未经股东允许擅自买卖股权的情况，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并采取相应的法律措施来维护自己的权益。
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