结论：在对方已申请司法拘留且您跑掉的情况下，若后续还上钱，是否还会被拘留需分情况讨论。一般来说，如果债务已经清偿，且不存在其他需要拘留的情形，通常不会再被拘留；但如果存在逃避执行等恶劣情节，即便还钱也可能面临其他法律后果。以下为详细分析：
一、司法拘留的性质与目的
司法拘留是人民法院对妨害民事诉讼、执行的行为人依法采取的强制措施，其目的在于保障诉讼和执行的顺利进行，维护法律的尊严和权威。在债务纠纷中，如果债务人拒不履行生效法律文书确定的义务，债权人可以向人民法院申请强制执行，人民法院在执行过程中，如果发现债务人有妨害执行的行为，如隐藏、转移财产，逃避执行等，可以依法对其采取司法拘留措施。
二、还钱后是否还会被拘留
债务已清偿且无其他妨害执行行为：
- 如果您在跑掉后，最终还清了债务，且在整个过程中没有实施其他妨害执行的行为，如隐藏、转移财产等，那么人民法院通常不会再对您采取司法拘留措施。因为此时债务已经得到清偿，执行的目的已经实现，再采取拘留措施已无必要。
存在逃避执行等恶劣情节：
- 如果您在跑掉期间，实施了逃避执行的行为，如隐藏、转移财产，或者拒不配合人民法院的执行工作，导致执行工作受到严重阻碍，那么即便您最终还清了债务，人民法院也可能根据您的行为情节，依法对您采取罚款、拘留等强制措施。这是因为您的行为已经构成了对法律尊严和权威的挑战，需要受到相应的法律制裁。
三、法律建议
积极履行债务：
- 无论您目前是否面临司法拘留的风险，都应该积极履行债务，避免债务问题进一步恶化。如果确实无力一次性偿还债务，可以与债权人协商分期偿还或者寻求其他合法的债务解决方案。
配合人民法院的执行工作：
- 如果您已经收到人民法院的执行通知书或者相关法律文书，应该积极配合人民法院的执行工作，如实申报财产状况，提供必要的执行线索等。不要试图逃避执行或者抗拒执行，否则可能会面临更严重的法律后果。
寻求法律帮助：
- 如果您对债务问题或者执行程序存在疑问或者困惑，可以及时向专业的律师咨询，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律风险。律师可以根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。
最后，债务问题应该通过合法、合理的途径解决，不要试图逃避或者抗拒执行。如果您有任何疑问或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。