结论：对于超市盗窃21次、金额900元的情况，公安机关一般会先进行立案调查，后续可能根据具体情节，采取行政处罚或刑事处罚措施。以下为详细分析：

1. 立案调查

   • 公安机关在接到超市报案后，会依法开展立案调查工作。这包括收集相关证据，如超市的监控录像、商品丢失记录、可能的目击者证言等，以确定盗窃行为是否确实发生以及行为人的具体身份等信息。
   • 由于该行为涉及多次盗窃，即使单次金额可能不大，但累计次数较多，公安机关会重视此类案件的调查，以维护社会治安和商家权益。

2. 行政处罚可能性

   • 如果公安机关认为盗窃行为情节较轻，尚未达到刑事犯罪的标准，可能会依据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，对行为人进行行政处罚。
   • 根据该法第四十九条，盗窃公私财物的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款。在此案例中，多次盗窃的行为可能被认定为“情节较重”，从而面临较重的行政处罚。

3. 刑事处罚可能性

   • 如果公安机关在调查过程中发现盗窃行为情节严重，符合刑事犯罪的构成要件，可能会将案件移送检察机关审查起诉，最终由法院进行刑事审判。
   • 根据《中华人民共和国刑法》第二百六十四条，盗窃公私财物，数额较大的，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。在此案例中，虽然盗窃金额900元可能未达到某些地区“数额较大”的标准（一般为一千元至三千元以上），但“多次盗窃”（通常指二年内盗窃三次以上）已经构成盗窃罪的入罪条件之一。因此，行为人有可能面临刑事处罚。

4. 量刑考虑因素

   • 如果行为人被追究刑事责任，法院在量刑时会考虑多种因素，包括盗窃的次数、金额、行为人的认罪态度、是否有前科等。
   • 在此案例中，行为人盗窃21次，属于多次盗窃且情节较为严重，这可能会成为法院量刑时的加重情节。同时，如果行为人能够积极认罪、赔偿超市损失并取得谅解，也可能在量刑时得到一定的从轻处理。