农民维护自己的合法权益阻挠工程施工是否违法，需根据具体情况判断。以下从多个角度进行分析：
可能构成违法的情况
违反《治安管理处罚法》：
- 法条依据：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第二十三条，扰乱企业事业单位秩序，致使工作、生产不能正常进行，尚未造成严重损失的，将面临警告、罚款或拘留等处罚。
- 具体表现：若农民无合理理由，通过静坐、围堵等方式阻止施工，导致施工无法正常进行，即构成对此法条的违反。例如，某建设工程已获审批并正在施工，农民无故聚集阻拦施工车辆进出，影响工程进度，就可能面临治安管理处罚。
触犯刑法：
- 法条依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百九十条，聚众扰乱社会秩序，情节严重，造成重大损失的，首要分子和积极参加者将面临有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利等刑罚。
- 具体表现：在大型建设工程中，若少数农民煽动群众聚众围堵施工现场，导致工程延误并造成重大经济损失，即可能触犯此罪名。这种情况下，农民的行为不仅违法，还可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
可能不构成违法的情况
- 合理诉求与合法表达：若农民有合理合法的诉求（如施工导致的环境污染、土地补偿问题等），且通过合法、理性的方式（如派代表沟通、向相关部门反映）反映问题并要求解决，在问题未得到妥善处理之前暂时阻止施工，一般不认定为违法。这种情况下，农民的行为属于维护自身合法权益的正当行为，但应当注意方式方法，避免过度阻挠施工。
综合建议
- 遵守法律法规：无论何种情况，农民都应遵守法律法规，以和平、理性的方式解决问题。阻挠施工不是解决问题的最佳方式，反而可能引发更多的法律纠纷。
- 合法表达诉求：对施工活动有异议或担忧时，应通过合法途径表达自己的意见和诉求，如向相关部门反映问题、寻求法律援助或参与听证会等。这样既能维护自己的合法权益，又能避免不必要的法律风险。
- 避免过激行为：即使有合理诉求，也应避免采取过激或违法的阻碍施工行为。过激行为不仅可能触犯法律，还可能对自身和他人造成不必要的伤害。
总结来说，农民在维护自己的合法权益时，应当遵守法律法规，通过合法、理性的方式表达诉求。阻挠施工是否违法，取决于具体行为是否合法、合理以及是否造成了不良后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。