核心结论：针对您将土地款支付给合同相对方（对方父亲）的儿子这一情况，需分情形处理，关键在于判断儿子收款行为是否构成表见代理或得到父亲追认，以下是具体分析及建议。

一、若儿子收款行为构成表见代理

1. 构成要件：根据《民法典》第172条，表见代理需满足两个条件：一是相对人（您）有理由相信行为人（儿子）有代理权；二是相对人善意且无过失。例如，对方父亲曾多次让儿子代收款项，或儿子持有父亲出具的收款委托书、合同等文件，使您基于合理判断认为儿子有权收款。
2. 法律后果：若构成表见代理，儿子收款行为的法律后果直接由父亲承担，即视为父亲已收到土地款，合同可继续履行。您无需再向父亲重复支付款项，但需保留好支付凭证（如转账记录、收条等）及能证明表见代理的证据（如委托书、过往交易记录等），以备后续争议。

二、若儿子收款行为不构成表见代理，但父亲事后追认

1. 追认方式：父亲可通过书面声明、口头确认（需有证据证明）或实际履行合同义务（如交付土地）等方式，明确表示认可儿子的收款行为。
2. 法律后果：追认后，儿子收款行为自始有效，合同继续履行。您同样需保留追认证据及支付凭证，确保权益不受损。

三、若儿子收款行为既不构成表见代理，父亲也未追认

1. 法律后果：儿子收款行为属于无权代理，父亲有权拒绝承认，您可能面临已支付款项无法直接抵扣合同价款的风险。此时，您可采取以下措施：
   • 与父亲协商：说明情况，要求父亲确认收款或重新出具收款凭证，确保合同履行。
   • 向儿子追偿：若儿子无合法依据收取款项，构成不当得利，您可依据《民法典》第985条要求其返还。但需注意，若儿子将款项转交父亲，可能涉及实际受益人认定问题，需结合具体证据分析。
   • 解除合同并索赔：若因儿子收款导致合同无法履行或您遭受损失（如资金占用利息、交易机会丧失等），可依据《民法典》第563条、第577条要求解除合同，并要求父亲赔偿损失。但需证明父亲存在过错（如未妥善管理收款事宜、未及时告知您收款方式等）。

四、实务建议

1. 固定证据：立即收集所有与交易相关的证据，包括合同、支付凭证、沟通记录（如微信、短信、录音等）、儿子收款时的场景证明（如照片、视频等），以证明您已履行付款义务及儿子收款的事实。
2. 书面催告：向父亲发送书面催告函（可留存邮寄凭证或电子送达记录），要求其确认收款或采取补救措施，为后续可能的诉讼或协商保留证据。
3. 协商优先：在证据充分的情况下，优先与父亲协商解决，避免诉讼成本。可提出由父亲出具收款确认书、重新签订补充协议等方案，明确双方权利义务。
4. 诉讼准备：若协商无果，可准备起诉材料，以父亲为被告，儿子为第三人（若其与案件处理结果有法律上的利害关系），向法院提起合同纠纷之诉，要求父亲继续履行合同或赔偿损失。

总结：您需根据儿子收款行为是否构成表见代理或父亲是否追认，采取不同策略。关键在于固定证据、明确法律关系，并通过协商或诉讼维护权益。如有进一步疑问或需具体操作指导，可随时向我咨询。