您好，关于建设工程合同缴纳印花税的依据，这是一个涉及税收法规的重要问题，我将为您详细解答。
首先，建设工程合同印花税的计税依据是合同所列的金额，但这里需要明确的是，此金额并不包括列明的增值税税款。根据《中华人民共和国印花税法》的相关规定，企业在计算印花税时，应将合同中的增值税税额剔除，仅就剩余的合同金额作为计税基础。
具体来说，有以下几点需要注意：
计税依据的确定：
- 如果合同中分别列明了金额和增值税税款，那么印花税的计税依据就是合同金额（不含增值税）。
- 如果合同中未分别列明金额和增值税税款，或者虽然列明但属于价税合并收取的情况，即增值税税款未单独清晰列出，那么此时需按照合同的含税金额作为印花税的计税依据。
税率与计算公式：
- 建设工程合同的印花税税率为0.3‰。
- 应纳税额的计算公式为：应纳税额 = 合同金额（不含增值税）× 税率。
实际操作中的注意事项：
- 准确记录合同金额：企业在签订合同时，应确保合同条款清晰明确，准确记录工程总价款，为后续计算印花税提供可靠依据。
- 剔除增值税：如果合同金额中包含增值税，务必在计算印花税前将增值税部分剔除。
- 关注合同变更：对于合同变更或补充协议，也应及时纳入计税范围，确保计税金额的准确性。
- 了解并利用地方政策：企业应密切关注地方政府出台的税收优惠政策，充分利用以降低税务负担。
多方参与合同的税务处理：
- 对于多方参与的施工合同，同一应税凭证由两方以上当事人书立的，应按照各自涉及的金额分别计算应纳税额。
- 如果应税合同未列明金额，而在后续实际结算时确定金额的，纳税人应在书立应税合同的首个纳税申报期申报合同情况，并在实际结算后下一个纳税申报期以实际结算金额计算申报缴纳印花税。
举例说明：
假设某建设工程合同的总金额为1000万元，其中增值税为90万元（税率为9%），那么印花税的计税依据就是1000万元减去90万元，即910万元。按照0.3‰的税率计算，应纳税额就是910万元乘以0.3‰，等于2730元。
综上所述，企业在处理建设工程合同印花税时，应严格遵守相关税收法规，确保计税依据的准确性，并合理利用税收政策以降低税务成本。希望这个解答能够帮助您更好地理解建设工程合同缴纳印花税的依据。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。