结论：自离手续办理后，劳动者通常有权获得其应得的工资报酬，但具体能否全额获得及是否需承担其他后果，需结合公司规章制度、劳动合同及相关法律法规综合判断。
详细分析如下：
法律层面分析：
- 工资支付原则：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，工资是劳动者劳动的报酬。只要劳动者为用人单位提供了实际劳动，无论其离职方式如何，用人单位都应当按照劳动合同的约定以及法律规定支付相应工资。这意味着，即使劳动者自离，用人单位也不能以此为由克扣或拒发劳动者已工作期间的工资。
- 经济损失赔偿：然而，如果劳动者自离给用人单位造成了经济损失，并且这种损失有明确的证据证明其存在以及与劳动者自离行为之间的因果关系，用人单位有权要求劳动者承担赔偿责任。在赔偿时，用人单位通常会从应支付的工资中扣除相应部分，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
公司规定与实际操作：
- 公司政策差异：不同的公司对于自离员工的工资处理方式可能会有所不同。一些公司可能会规定，在员工自离后的某个时间段内（如离职当月），仍然会按照员工实际出勤的天数来计算并发放工资。而另一些公司则可能会因为员工自离而拒绝支付任何工资或奖金等福利待遇。因此，劳动者在自离前最好先查阅所在公司的相关规定，了解公司对于自离员工工资的具体处理方式。
- 沟通协商的重要性：为了避免不必要的纠纷和损失，建议劳动者在决定自离前尽量通过正规渠道与公司沟通协商离职事宜。如果自离后用人单位拒绝支付工资，劳动者可以先与用人单位进行沟通协商；协商不成的，可向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位支付工资；还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己获取工资的合法权益。
特殊情况处理：
- 未办理离职手续的自离：如果劳动者自离后未办理离职手续，但已经为公司提供了劳动，那么理论上仍然有权获得相应的工资报酬。不过，由于未办理离职手续，可能会影响工资的结算和支付时间。在这种情况下，劳动者应尽快与公司联系，补办离职手续，以便及时获得工资。
- 工资结算与支付时间：如果劳动者在离职时尚未到达公司固定的发工资日期，工资可能会在下一个固定的发工资时间进行结算并支付。劳动者应了解公司的薪酬制度和发工资时间，以便合理安排自己的财务计划。
建议与行动指南：
- 了解公司规定：在自离前，劳动者应尽可能了解所在公司的相关规定，包括离职手续、工资结算和支付等方面的规定。
- 沟通协商：如果可能的话，劳动者应尽量通过正规渠道与公司沟通协商离职事宜，以避免不必要的纠纷和损失。
- 法律途径维权：如果用人单位拒绝支付工资或办理离职手续，劳动者可以通过向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。
总结：自离手续办理后，劳动者通常有权获得其应得的工资报酬。但具体能否全额获得及是否需承担其他后果，需结合公司规章制度、劳动合同及相关法律法规综合判断。劳动者应了解自己的合法权益和维权途径，以便在必要时采取适当的法律行动。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。