结论：集体用地个人建设的厂房，在法院执行过程中能否拍卖，需根据具体情况判断，主要取决于土地性质、厂房建设合法性以及是否具备处置条件等因素。以下从不同角度进行详细分析：

1. 土地性质与厂房建设合法性

   • 集体建设用地：根据《土地管理法》等相关法律法规，集体建设用地通常用于乡镇企业、乡（镇）村公共设施和公益事业建设等。若个人在集体建设用地上建设厂房，需确保已依法取得土地使用权，并符合当地土地利用总体规划和城乡规划。
   • 建设合法性：厂房建设需办理相关审批手续，如建设工程规划许可证、施工许可证等。若厂房建设未经合法审批，可能被认定为违法建筑，面临拆除风险，此时法院执行拍卖的难度较大。

2. 法院执行拍卖的条件

   • 产权清晰：厂房需具备清晰的产权证明，如房产证或不动产权证。若产权存在争议或未办理产权登记，法院可能无法直接拍卖。
   • 可处置性：厂房需具备可处置性，即能够通过拍卖等方式变现。若厂房因土地性质、规划限制等原因无法转让或过户，法院可能无法执行拍卖。
   • 执行依据：法院执行拍卖需有明确的执行依据，如生效的判决书、裁定书等。若缺乏执行依据，法院无法启动拍卖程序。

3. 不同情况下的处理方式

   • 合法建设的厂房：若厂房建设合法，产权清晰，且具备可处置性，法院在执行过程中可以依法进行拍卖。拍卖所得款项将用于偿还债务或履行其他法律义务。
   • 违法建设的厂房：若厂房建设违法，法院可能无法直接拍卖。此时，法院可能先要求拆除违法建筑，再对剩余部分或土地进行处置。若拆除后无剩余价值，法院可能终结执行程序。
   • 产权争议或未登记的厂房：若厂房产权存在争议或未办理产权登记，法院可能先要求解决产权问题。在产权问题解决前，法院可能无法执行拍卖。

4. 法律建议

   • 核实土地性质与厂房建设合法性：在涉及集体用地个人建设厂房的法院执行拍卖问题时，首先需核实土地性质和厂房建设合法性。确保厂房建设符合当地规划和法律法规要求。
   • 办理产权登记：若厂房尚未办理产权登记，建议尽快办理相关手续，以明确产权归属，为法院执行拍卖提供便利。
   • 咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，帮助当事人维护合法权益。

总结：集体用地个人建设的厂房在法院执行过程中能否拍卖，需综合考虑土地性质、厂房建设合法性、产权清晰度以及可处置性等因素。若厂房建设合法且产权清晰，法院在执行过程中可以依法进行拍卖；若存在违法建设或产权争议等问题，则可能面临执行困难。因此，在处理此类问题时，建议当事人核实相关情况并咨询专业律师以获取准确法律意见。