康复师与医院进行合作是合法的，并且这种合作模式在当前的医疗体系中是被鼓励和支持的。以下是对这一问题的详细解答：

一、政策支持与鼓励

1. 医养结合政策：根据国家卫生健康委办公厅、民政部办公厅等部门联合发布的关于深化医疗卫生机构与养老机构协议合作的通知，医疗卫生机构与养老机构（包括康复机构）的协议合作是医养结合服务的重要方式。这一政策为康复师与医院的合作提供了明确的政策支持和指导。

2. 康复医疗服务试点：国家卫生健康委还发布了关于开展康复医疗服务试点工作的通知，旨在加快发展康复医疗服务，满足群众多样化康复医疗服务需求。试点地区被鼓励探索多元化康复医疗服务模式，包括加强康复医疗学科能力建设、创新开展康复医疗多学科合作模式等，这为康复师与医院的合作提供了更广阔的空间和机遇。

二、合作模式的合法性

1. 平等自愿原则：康复师与医院的合作应遵循平等自愿的原则，双方根据各自的需求和实际情况，协商确定合作内容、方式等，确保合作的合法性和合规性。

2. 资质与能力要求：医疗卫生机构（包括医院）应当具备相应资质和能力，康复师也应当具备相应职业资格。在合作过程中，双方应依法依规开展服务，确保服务质量和安全。

3. 协议合作文本：为了规范合作行为，国家还提供了医疗卫生机构与养老服务机构签约合作服务指南和协议合作文本参考，康复师与医院的合作也可以参照这些指南和文本进行，以确保合作的规范化和标准化。

三、合作模式的实践与探索

1. 多层次合作：康复师可以与综合医院、中医医院、专科医院等不同层次的医疗机构开展合作，根据医院的需求和康复师的专业特长，提供个性化的康复服务。

2. 嵌入式服务：有条件的医院可以在内部设立康复医疗服务站点或家庭医生工作室，康复师可以在这些站点或工作室为患者提供就近就便的康复服务。

3. 托管式合作：医院还可以探索将内设的康复科室或康复中心托管给专业的康复机构或康复师团队管理运营，以提高康复服务的质量和效率。

四、合作的意义与价值

康复师与医院的合作不仅有助于提升康复服务的质量和效率，满足群众多样化的康复需求，还有助于推动康复医疗学科的发展和创新。通过合作，康复师可以获得更多的实践机会和职业发展空间，医院也可以借助康复师的专业力量提升自身的康复服务能力。