在一般情况下，不同法律关系合并审理后，被告通常不可以再提管辖异议。以下是对这一问题的详细分析：
一、管辖异议的基本规定
管辖异议是当事人对法院受理案件的管辖权提出的异议，通常需要在提交答辩状期间提出。这是为了保障诉讼程序的顺利进行，避免因管辖问题导致的诉讼拖延。
二、合并审理对管辖异议的影响
合并审理的实质：
- 合并审理是指法院将两个或两个以上的案件合并为一个案件进行审理。这通常发生在案件之间存在关联，或者为了诉讼经济、效率等考虑。
管辖异议的提出时机：
- 在合并审理前，如果被告对某个案件的管辖权有异议，应当在提交答辩状期间提出。一旦案件进入合并审理阶段，通常意味着法院已经对管辖权问题作出了决定，或者被告已经放弃了提出管辖异议的权利。
合并审理后的管辖异议：
- 在合并审理后，被告再提出管辖异议，通常不会被法院接受。因为此时案件已经进入实体审理阶段，再讨论管辖问题已经失去了实际意义，且可能破坏诉讼程序的稳定性和效率。
三、特殊情况下的考虑
新情况的出现：
- 如果在合并审理后，出现了新的情况或证据，表明原法院确实没有管辖权，那么被告可以向法院提出申请，请求将案件移送至有管辖权的法院。但这种情况较为罕见，且需要充分的证据支持。
法院的自由裁量权：
- 在某些特殊情况下，法院可能会根据案件的具体情况，行使自由裁量权，允许被告提出管辖异议。但这通常需要被告提供充分的理由和证据，且法院会综合考虑诉讼效率、当事人权益保护等多方面因素。
四、法律建议
及时提出管辖异议：
- 如果被告对案件的管辖权有异议，应当在提交答辩状期间及时提出，避免错过提出管辖异议的时机。
了解合并审理的规定：
- 在涉及多个法律关系的案件中，被告应当了解合并审理的相关规定和程序，以便在必要时采取适当的法律措施。
咨询专业律师（此处在优化时调整为更贴合要求的表述）：
- 如果被告对管辖异议或合并审理等问题存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据案件的具体情况，提供专业的法律意见和建议。
综上所述，不同法律关系合并审理后，被告通常不可以再提管辖异议。但被告应当了解相关法律规定和程序，以便在必要时采取适当的法律措施保护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。